Apipjaustymas, apyvarpės pašalinimas iš varpos, daro įtaką ŽIV viruso, sukeliančio AIDS, perdavimo tikimybei. Apipjaustymas ir AIDS yra susiję, nes apipjaustyti vyrai iš tikrųjų rečiau serga šia liga nei neapipjaustyti vyrai. Tai gali būti dėl apyvarpės pažeidžiamumo viruso infekcijai. Pati operacija nesukelia AIDS.
Mažai tikėtina, kad apipjaustymo procedūra perduotų AIDS, nes paprastai kito asmens kūno skysčiai pacientui nepatenka. ŽIV virusas perduodamas iš žmogaus į asmenį per kraują, makšties skysčius, spermą ir motinos pieną. Kol procedūra atliekama tinkamai, švariais instrumentais ir dezinfekavimo priemonėmis, apipjaustomas žmogus AIDS nesusirgs.
Pripažinta apipjaustymo ir AIDS sąveika gali padėti šalims, kenčiančioms nuo AIDS epidemijų, sumažinti užsikrėtimo dažnį. Pasaulio sveikatos organizacijos (PSO) duomenimis, heteroseksualus vyras, kuris yra apipjaustytas, turi 60 procentų mažesnę tikimybę užsikrėsti ŽIV nei neapipjaustytas heteroseksualus vyras. JAV ligų kontrolės ir prevencijos centrai (CDC) taip pat sutinka, kad apipjaustymas sumažina ŽIV infekcijos riziką. Nuo 2011 m. CDC įspėja, kad apipjaustymo ir AIDS tyrimai rodo, kad makšties lytinių santykių rizika yra mažesnė, o ne kitų lytinių santykių formų.
Nors apipjaustyti vyrai gali turėti mažesnę riziką susirgti AIDS nei kiti vyrai, procedūra veiksmingai neapsaugo nuo infekcijos. Apipjaustytas vyras vis tiek turėtų užsiimti saugiu seksu ir, jei reikia, reguliariai tikrintis. Apipjaustymas taip pat sumažina riziką užsikrėsti kitomis lytiškai plintančiomis infekcijomis, kurios gali padėti plisti AIDS. Remiantis CDC, neaiškūs įrodymai, kad ŽIV perdavimas iš apipjaustyto vyro sumažėjo moteriai ar vyrui.
Apyvarpė turi kitokias savybes nei aplink ją esanti oda. Vidus yra mažiau sausas ir jautresnis mikroskopiniams plyšimams. Šios ašaros gali atsirasti lytinio akto metu ir per apsauginį odos barjerą prasiskverbia virusinės dalelės. ŽIV virusas taikosi į specifines ląsteles, o apyvarpėje yra daug šių ląstelių. Apyvarpės buvimas reiškia, kad vyras taip pat labiau linkęs sirgti kitomis lytiškai plintančiomis infekcijomis, kurios padidina ŽIV perdavimo riziką.
Koreliacija tarp apipjaustymo ir AIDS rodo, kad procedūra yra naudinga priemonė mažinant ligos paplitimą. Operacija kelia nedidelę infekcijos riziką. PSO duomenimis, mažiau nei vienas iš 500 kūdikių patiria komplikacijų dėl apipjaustymo. Suaugusiųjų apipjaustymas yra rizikingesnis ir iki keturių procentų šių pacientų patiria komplikacijų.