Kenkėjiška programa gali nutikti bet kam. Ši kenkėjiška programinė įranga gali sulėtinti kompiuterį, užkimšti ekraną iššokančiaisiais skelbimais ir apsaugoti žmones nuo tapatybės vagystės. Egzistuoja daugybė metodų, kuriuos galima naudoti norint atsikratyti jai pasirodžius kenkėjiškų programų ir pirmiausia sumažinti riziką, kad jos bus užkrėstos. Kompiuterių naudotojams svarbu nedelsiant atnaujinti savo programinę įrangą ir operacines sistemas, kai pasirodo naujos versijos ir pataisymai, nes tai radikaliai sumažins virusų ir kenkėjiškų programų riziką.
Vienas iš būdų atsikratyti kenkėjiškų programų yra sumokėti kam nors kitam, kad tai padarytų. Daugelis kompiuterių pagalbos įmonių už nedidelį mokestį atsikratys kenkėjiškų programų. Šie specialistai gali greitai ir kruopščiai atlikti darbą, taip pat paprastai atnaujins kompiuterio programinę įrangą ir operacinę sistemą, kad įsitikintų, jog viskas vyks sklandžiai.
Taip pat yra veiksmų, kuriuos atskiri kompiuterių naudotojai gali atlikti norėdami išvalyti kenkėjiškas programas. Pirmas dalykas, kurį reikia padaryti, yra atidaryti kompiuterio antivirusinę programinę įrangą ir atlikti nuskaitymą. Antivirusinė programinė įranga paprastai apima kenkėjiškų programų aptikimą, o programinė įranga gali rasti ir sunaikinti kenkėjiškas programas. Ši programinė įranga veiksminga tik tada, kai ji atnaujinama reguliariai, todėl vartotojai turėtų užtikrinti, kad naujinimai ir visa sistema nuskaitoma reguliariai, kad jų kompiuteriai būtų apsaugoti. Žmonėms, kuriems antivirusinė programinė įranga atrodo per brangi, kelios įmonės siūlo savo produktų versijas nemokamai; „Avira’s AntiVir“ yra nemokamo antivirusinio produkto pavyzdys.
Taip pat galima atsikratyti kenkėjiškų programų naudojant kenkėjiškų programų valiklį arba kenkėjiškų programų pašalinimo įrankį – programą, kuri yra specialiai sukurta kenkėjiškoms programoms surasti ir pašalinti. Tačiau žmonės turėtų būti atsargūs atsisiųsdami kenkėjiškų programų valiklius, nes daugelis kenkėjiškų programų gamintojų maskuoja savo produktus kaip antivirusinę ar kenkėjiškų programų šalinimo programinę įrangą. Kai kurie geri produktai yra „Malwarebytes“ skirta „Anti-Malware“ arba „Lavasoft“ „Ad-Aware“. Vartotojai visada turėtų atsisiųsti iš patikimos svetainės, pvz., CNet, ir atkreipti dėmesį į tai, kas yra adreso juostoje, kad įsitikintų, jog atsisiunčia programinę įrangą iš patikimo šaltinio. Norėdami atsikratyti kenkėjiškų programų, „Windows“ vartotojai gali pasinaudoti kenkėjiškos programinės įrangos pašalinimo įrankiu, kurį galima nemokamai įsigyti „Windows“ svetainėje.
Netyčinio kenkėjiškų programų atsisiuntimo riziką galima sumažinti naudojant naujausią žiniatinklio naršyklės versiją ir nuolat įjungus antivirusinę apsaugą. Kompiuterių naudotojai taip pat turėtų būti atsargūs atsisiųsdami ir atidarydami priedus, įsitikindami, kad medžiaga gaunama iš patikimo šaltinio.