Dauguma didelių organizacijų naudoja programinę įrangą, kad sukurtų ir tvarkytų savo darbuotojų darbo užmokesčio čekius. Ši programinė įranga leidžia visiškai automatizuoti visą įmonės darbo užmokestį. Geriausia darbo užmokesčio programinė įranga šiandien paprastai užtikrina visišką darbo užmokesčio fondo mokesčių, tiesioginių indėlių ir taupomosios sąskaitos išmokėjimų automatizavimą. Ši programinė įranga yra integruota su automatizuotomis darbo laiko apskaitos sistemomis, kad būtų užtikrintas visas darbuotojų darbo užmokesčio valdymo procesas.
Darbo užmokesčio apskaitos programinė įranga sumažina organizacines išlaidas, nes automatizuoja darbuotojų darbo užmokesčio čekių kūrimą. Ši sistema paprastai sukonfigūruojama su laiko apskaitos valdymo programa, kuri seka kiekvieno darbuotojo darbo valandas. Darbo užmokesčio programinė įranga parengia atlyginimo čekius nustatytais intervalais. Tai gali būti sukonfigūruota savaitės, mėnesio ar ketvirčio tikrinimo ciklams.
Internete yra daug internetinių atlyginimų paslaugų teikėjų. Šios įmonės nuotoliniu būdu valdo įmonės darbo užmokesčio apskaičiavimo procesą. Šiame paslaugų modelyje naudojama automatizuota darbo užmokesčio programinė įranga. Dauguma darbo užmokesčio apskaitos paslaugų teikėjų apmokestina vartotojus pagal darbuotojų, kurie naudojasi paslauga, skaičių. Ši paslauga laikoma įmonės darbo užmokesčio apskaitos proceso perdavimu.
Dauguma mažų įmonių tvarko savo darbo užmokesčio apskaičiavimą. Yra daug darbo užmokesčio programinės įrangos paketų, kuriuos galima įdiegti vietiniame kompiuteryje. Ši programinė įranga skiriasi kaina ir sudėtingumu. Be to, internete yra keletas nemokamų darbo užmokesčio skaičiavimo programinės įrangos versijų. Paprastai jie puikiai tinka mažoms pradedančioms įmonėms, turinčioms ribotą biudžetą.
Paycheck programinė įranga yra prieinama kelioms operacinėms sistemoms. Tai apima „Windows“, „Mac“ ir „Linux“. Pirkdamas darbo užmokesčio programą vartotojas turėtų įsitikinti, kad ji suderinama su operacine sistema ir jo naudojamais kompiuteriais. Tai užtikrina, kad programinė įranga atitiks įmonės standartus ir dirbs su įmonės technine įranga.
Kelios darbo užmokesčio programinės įrangos programos yra skirtos integruoti į komercines apskaitos sistemas. Tai yra geras būdas tvarkyti apskaitą, o tai gali padėti rengiant mėnesio ir ketvirčio finansines ataskaitas. Pilnas apskaitos paketas supaprastina įmonės finansų valdymo procesą. „Viskas įskaičiuota“ paketas, kuris paprastai yra ekonomiškesnis.
Programinė įranga kaip paslauga (SAAS) yra naujas kompiuterių programinės įrangos valdymo internete metodas. Daugelis komercinių įmonių siūlo darbo užmokesčio skaičiavimo programinės įrangos sistemas naudodamos SAAS modulį. Tai paprastai yra pigesnė nei dauguma programinės įrangos, nes ji pagrįsta darbuotojų skaičiumi įmonėje, o ne vienoda programinės įrangos kaina. SAAS moduliai šiuo metu naudojami pardavimų, žmogiškųjų išteklių, apskaitos ir klientų valdymo.