Geriausias natūralus graikiškas jogurtas yra tirštas, kreminis ir be priedų bei konservantų. Autentiškame natūraliame graikiškame jogurte nėra tirštiklių, tokių kaip želatina ar kukurūzų krakmolas, tačiau jis yra natūraliai tirštas dėl skystų išrūgų nuvalymo. Tai koncentruoja ir padidina baltymų kiekį jogurto dėžutėje, tačiau šiek tiek sumažina kalcio kiekį. Geriausias natūralus graikiškas jogurtas gali būti brangesnis nei kitų rūšių, nes jam pagaminti reikia maždaug tris kartus daugiau pieno.
Graikiškame jogurte gausu maistinių medžiagų ir draugiškų bakterijų. Tiek įprastas, tiek natūralus graikiškas jogurtas gaminamas į pieną įdedant gyvų bakterijų – Streptococcus thermophilus ir Lactobacillus bulgaricus – kultūras, kad šis fermentuotųsi. Tada iš graikiško jogurto pašalinamos skystos išrūgos, kad sutirštėtų konsistencija. Palyginus įprasto jogurto dėžutę su natūralaus graikiško jogurto dėžute, matyti, kad graikiškame jogurte yra daugiau kalorijų ir daug daugiau baltymų, bet mažiau kalcio, palyginti su įprastame jogurte.
Jogurtai su ilgu ingredientų sąrašu yra tie, į kuriuos buvo pridėta užpildų, tokių kaip tirštikliai, saldikliai ir dirbtiniai skoniai bei dažikliai. Šie ingredientai sumažina naudingumą ir padidina kalorijų skaičių, todėl geriausia pirkti jogurtą, kuriame yra mažiausiai ingredientų. Natūralaus graikiško jogurto atveju tai turėtų būti pieno grietinėlė, jogurto kultūra ir karvės arba avies pienas. Ant dėžutės turi būti etiketė, nurodanti, kad jogurto kultūra yra gyva ir aktyvi.
Probiotikų arba gyvų kultūrų yra visuose natūraliuose graikiškuose jogurtuose. Jie skatina ląstelinį imunitetą, gerina žarnyno sveikatą ir didina gerojo cholesterolio kiekį. Nors visi jogurtai gaminami naudojant bakterijų kultūras, ne visuose jų yra vienodai. „Gyvosios kultūros“ etiketė ant dėžutės reiškia, kad jogurte yra didelis kultūros kiekis viename grame produkto. Kai kurios įmonės prideda papildomų probiotikų ir kultūrų, siekdamos reklamuoti jogurtą kaip dar naudingesnį imunitetui ir virškinimo sveikatai. Kai kurie jogurtai po fermentacijos yra termiškai apdorojami ir tai sunaikins daugumą naudingų bakterijų.
Natūralus jogurtas be papildomų ingredientų, kuris nebuvo termiškai apdorotas ir pažymėtas „gyvos kultūros“ etikete, visada bus sveikiausias pasirinkimas. Išskyrus tai, tai tiesiog skonio reikalas. Kai kuriems žmonėms, kurie yra įpratę prie saldintų produktų, natūralaus graikiško jogurto skonis gali būti šiek tiek aštrus arba aitrus, tačiau kremiškumas ir tekstūra daugeliui yra tinkama kompensacija.