Geriausio prototipo medžiagos pasirinkimas konkrečiam produktui ar išradimui priklauso nuo daugelio veiksnių, įskaitant biudžetą, pristatymą, laiką ir kiekį. Galutinė prototipo dalies ar gaminio funkcija dažniausiai lemia medžiagą, iš kurios gaminamas prototipas. Veikiančio prototipo kūrimas gali būti paprastas kai kurių paprastų namuose esančių medžiagų ar daiktų sujungimas. Medžiagos, naudojamos greitajam prototipų kūrimui (RP), gali pateikti išsamesnį prototipą, reikalingą pristatymui investuotojams, inžinieriams, rinkodaros specialistams, dizaineriams ar gamintojams. Kitos prototipinės medžiagos apima modelius, pagamintus iš silicio formų ir įvairių tipų plastikų arba dervos ir kitų medžiagų derinių.
Iš pradžių prototipinė medžiaga gali būti mediena, molis, derva arba šių ir kitų medžiagų derinys. Prieš nuspręsdami, kokios prototipinės medžiagos ar procesai bus naudojami, apsvarstykite išlaidas. Kai kurie iš sėkmingiausių gaminių iš pradžių buvo pagaminti iš labai neapdorotų prototipinių medžiagų arba namuose esančių daiktų, pavyzdžiui, kartono, vielos ir lipnios juostos. Kol parodoma, kaip gaminys veikia, prototipui gali būti naudojama bet kokia medžiaga. Viena iš nebrangių prototipinių medžiagų rūšių yra specialus plastikas, kuris tampa minkštas ir formuojamas kaitinant mikrobangų krosnelėje arba plaukų džiovintuvu.
Greitasis prototipų kūrimas naudoja techniką, vadinamą stereolitografija (SLA), kad būtų sukurti apčiuopiami prototipai iš kompiuterinio projektavimo (CAD) brėžinio. Šiame procese naudojama prototipinė medžiaga yra skysta derva, kuri apytiksliai suformuojama naudojant ultravioletinę lazerio spinduliuotę ir kietinama ultravioletinėje krosnyje. Tada baigtas SLA prototipas apdirbamas rankomis, kad atitiktų dizainerio specifikacijas. Šie SLA prototipai atrodo ir veikia kaip tikri ir pateikia praktinį, veikiantį gatavo produkto modelį, paruoštą pristatymui. Didžiausias privalumas naudojant šias dervos medžiagas yra greitas apyvartumas ir nedidelė net kelių dizaino iteracijų ar peržiūrų kaina.
Silicio formos ir skystas plastikas tikriausiai yra vienos ekonomiškiausių iš visų prototipų medžiagų, kai reikia tik nedidelio prototipų skaičiaus. Šis procesas, vadinamas kambario temperatūros vulkanizavimu (RTV), naudoja RP modelį, kad būtų sukurta pagrindinė forma iš silikoninės gumos. Skystas silikonas pilamas aplink RP modelį arba pagrindinį modelį, kad būtų sukurta neigiama forma. Šis procesas geriausiai tinka prototipams, kurių reikia per trumpą laiką. Pagaminta prototipo medžiaga dažniausiai yra dviejų dalių poliuretano, vaško ir silikoninės gumos derinys.