Nors failo įdėjimas į šiukšliadėžę ir ištrynimas gali būti geras būdas atsikratyti failo, tiesa ta, kad failas vis dar yra. Mintis, kad failo visiškai nebėra, yra įprasta klaidinga nuomonė, tačiau išmanesni kompiuterių vartotojai pradeda suprasti, kad failo ištrynimas iš tikrųjų nieko panašaus nedaro. Tai tiesiog paslepia failą iš kompiuterio. Tiems, kuriems tai kelia nerimą, yra keletas būdų, kaip kruopščiau ištrinti ištrintus failus.
Vienas iš paprasčiausių būdų ištrinti ištrintus failus yra formatuoti standųjį diską. Paprastai tai visiškai išvalys sistemą ir net programos, kurios paprastai naudojamos ištrintų failų atkūrimui, negalės jų rasti. Tai vienas drastiškiausių būdų atsikratyti failų, tačiau dažniausiai jis veikia.
Kitas būdas ištrinti ištrintus failus yra naudoti duomenų trynimo programą. Yra dviejų tipų duomenų trintukai. Kai kurie iš jų naudojami atskiriems failams. Kiti naudojami visam kietajam diskui. Pasirinkta parinktis paprastai priklauso nuo vartotojo, tačiau ne visi programinės įrangos produktai tinka abiems. Prieš pirkdami vartotojai turėtų suprasti, kuo skiriasi programinės įrangos produktai. Priešingu atveju yra didelė tikimybė, kad vartotojas gali nusivilti produktu.
Programinė įranga, kuri visiškai išvalo duomenis, yra labai panaši į standžiojo disko formatavimą. Tai visiškai ištrins ištrinti failus ir visus kitus kompiuteryje esančius failus. Tie, kurie naudojasi šia parinktimi, turėtų į tai labai atsižvelgti ir įsitikinti, kad yra visų svarbių failų atsarginės kopijos. Tai vienintelis būdas visiškai atkurti viską, ko reikia, kai programinė įranga baigia darbą.
Kitų tipų programinė įranga, naudojama ištrintiems failams ištrinti, gali būti naudojama tik pavieniams failams. Tokiai situacijai tikriausiai patiks dauguma kompiuterių vartotojų. Taip įrenginyje bus saugomi visi kiti failai, o vartotojas neteks daug laiko iš naujo įdiegti visus norimus programinės įrangos produktus kompiuteryje. Šio tipo programinė įranga kartais vadinama duomenų smulkintuvu ir iš esmės kelis kartus įrašo į failą su atsitiktiniais duomenimis. Kuo daugiau kartų failas perrašomas, tuo sunkiau atkurti pradinę informaciją.
Tiems, kurie ypač nerimauja dėl neskelbtinos informacijos, reikia pažymėti, kad tikrai nėra jokio būdo garantuoti, kad joks metodas naudojamas ištrintiems failams ištrinti. Visada gali būti tikimybė, kad kai kurie duomenys liks standžiajame diske atkuriamoje formoje, ypač dėl to, kad technologija visada keičiasi abiejose lygties pusėse. Be fizinio standžiojo disko sunaikinimo ir naujos aparatinės įrangos įdiegimo, kažkas vis tiek gali būti atkurta, jei įdedama pakankamai pastangų ir laiko. Tačiau daugeliu atvejų duomenų smulkinimo programos tinkamai atsikratys nepageidaujamų failų, nebent jų ieškantis asmuo yra labai gerai apmokytas.