Nors MHTML užkoduotame faile yra dalių, kurios yra grynas HTML kodas, bandant konvertuoti MHTML į HTML gali kilti komplikacijų. Kelios programos gali skaityti MHTML – arba daugiafunkcinius interneto pašto plėtinius (MIME) hiperteksto žymėjimo kalbą (HTML) – failus ir išvestinius formatus, tačiau norint konvertuoti ir įrašyti failo turinį į HTML, reikalinga speciali programa. Gali kilti problemų, nes skaitmeniniai duomenys iš svetainės yra užkoduoti faile, o svetainės atkūrimas su teisingomis nuorodomis į visą informaciją gali būti nelengva užduotis. Daugeliui operacinių sistemų yra programų, kurios leidžia konvertuoti iš MHTML į HTML, nors vartotojui gali prireikti papildomo darbo.
Pagrindinė problema konvertuojant failus iš MHTML į HTML yra dvejetainiai duomenys, įrašyti faile. Duomenys išsaugomi taip, kad MHTML failą būtų galima perskaityti ir rodyti žiniatinklio naršyklėje, tačiau nebūtų lengva konvertuoti tą patį failą. MHTML saugomas kaip tam tikras įterptasis kodas, kuris naudoja skirtingus kintamuosius, kad skaitmeninių failų vietos būtų tvarkomos. Dvejetainė informacija, pvz., internete esantis vaizdas, yra saugoma pradinėje svetainėje su nuorodomis į internetines vietas. Ši informacija pašalinama ir paverčiama vietiniais kintamaisiais naudojant MHTML failus, todėl sunku iš tikrųjų suderinti dvejetainę laikmeną su tinkama jos vieta ir formatavimu HTML dokumente.
Yra keletas programų, kurios gali konvertuoti MHTML į HTML. Yra papildinių ir kitų priedų, kurie gali leisti programai įkelti, redaguoti ir iš naujo įrašyti failą atgal į MHTML, tačiau yra tik keletas atskirų programų, kurios bandys jį konvertuoti į HTML. Dažnai šios programos reikalauja, kad vartotojas pažiūrėtų į kodą, kad išsiaiškintų, kur kode turėtų būti patalpinti dvejetainiai failai, kad būtų galima atkurti puslapį iš archyvo.
Ne visi tinklalapiai gali būti tiksliai įrašyti kaip MHTML failas. Įvairūs sudėtingi formatai, kuriuos galima įterpti kaip laikmeną svetainėje, nebus tinkamai išsaugoti, jei iš viso nebus išsaugoti. Tai apima Java® programėles, srautinę mediją ir daugybę scenarijų, kurie priklauso nuo kitų failų serveryje, prie kurių naršantis kompiuteris neturi prieigos.
Veiksmingiausias būdas konvertuoti MHTML į HTML yra rasti atskiras programas ir papildinius, kurie laipsniškai konvertuos failus iš vieno formato į kitą ir galiausiai galbūt į HTML. Kai kurios operacinės sistemos net nepalaiko MHTML failų savo naršyklėse. Nepavykus visko kito, galima rankiniu būdu iššifruoti dvejetainę MIME informaciją faile su baziniu 64 dekoderiu, išgauti tik HTML ir bandyti rankiniu būdu atkurti archyve saugomą svetainę, tačiau šis procesas būtų labai daug darbo reikalaujantis.