Dažniausias ir veiksmingiausias atskyrimo nerimo gydymas yra kognityvinė elgesio psichoterapija. Kiti gydymo būdai, kurie veikia su kognityvinio elgesio terapija, apima šeimos terapiją, desensibilizaciją, pokalbių terapiją ir vaistus. Svarbu pažymėti, kad vaistai turėtų būti naudojami tik esant dideliam atsiskyrimo nerimui ir tik kartu su kitais gydymo būdais. Prieš gydant atsiskyrimo nerimą, vaikas diagnozuojamas derinant informaciją, surinktą iš namų, mokyklos ir klinikinių vizitų.
Kognityvinė elgesio psichoterapija moko svarbių atsiskyrimo nerimo gydymo įgūdžių, pavyzdžiui, kaip atpažinti nerimą keliančius jausmus ir sukurti planą, kaip su jais susidoroti. Vaikas sužino, kaip jo fiziniai jausmai yra susiję su nerimo jausmu. Psichoterapeutas taiko žaidimų terapiją, modeliavimą, atsipalaidavimo terapiją, vaidmenų žaidimą, kad išmokytų vaiką efektyvių atsiskyrimo nerimo įveikos metodų.
Šeimos terapija dažnai naudojama kaip atsiskyrimo nerimo gydymo dalis. Tėvų ir brolių ir seserų įtraukimas į terapijos seansus moko visus, kaip geriau elgtis su nukentėjusiu vaiku, ir padeda spręsti konkrečias problemas, kurios gali sukelti arba pabloginti vaiko nerimą. Terapiniai užsiėmimai, kuriuose dalyvauja visa šeima, taip pat skatina komandinio darbo jausmą grupėje.
Desensibilizavimas yra atsiskyrimo nerimo gydymas, kurio metu atskyrimas atliekamas laipsniškai, matuojant laiką ir atstumą, per kurį atsiskyrimas. Tai leidžia vaikui palaipsniui įsijausti į atskirties jausmą. Gilus kvėpavimas, biologinis grįžtamasis ryšys ir savęs raminimo metodai, tokie kaip teigiamas kalbėjimas apie save, taip pat gerai derinami su kognityvine elgesio psichoterapija. Pokalbių terapija suteikia vaikui galimybę pasikalbėti apie problemas, kurios jį vargina, su žmogumi, išmokytu klausytis ir reaguoti naudingai. Pokalbių terapija nepakeičia intensyvesnės kognityvinės elgesio terapijos.
Vaikai, kuriems reikalingas išsiskyrimo nerimo gydymas, turi keletą tipiškų baimių ir rūpesčių. Jie bijo, kad išsiskyrimas taps nuolatinis, bijo, kad kažkas nutiks tiems, kuriuos myli, arba patiria košmarus apie išsiskyrimą. Vaikai, kenčiantys nuo išsiskyrimo, gali tapti prikibę, atsisakyti eiti į mokyklą, jiems sunku užmigti ar užmigti, o dėl artėjančio atsiskyrimo gali atsirasti skrandžio ar galvos skausmas.
Tėvai gali padėti savo vaikams siųsdami raštelius priešpiečių dėžutėse, apdovanodami vaiko pastangas sklandžiai išsiskirti, išlikdami ramūs išsiskyrimo laikotarpiu, formuodami ir palaikydami rutiną, skatindami vaikui patinkančią socialinę veiklą. Tėvai taip pat gali padėti, užtikrindami, kad jų pačių nerimas būtų kontroliuojamas. Jautrūs vaikai gali sugerti savo tėvų nerimą ir pabloginti jų problemą.