Nustatyti grandinės plokštės išdėstymą ir dizainą gali būti sunku, tačiau tinkama plokštės projektavimo programa gali palengvinti užduotį. Dauguma grandinių plokščių yra pagamintos iš skirtingų dalių, todėl didelė dalių biblioteka gali padaryti plokštės projektavimo programą naudingesnę. Dažnai reikia pridėti duomenų, kad plokštė veiktų, o projektavimo programa su importavimo funkcija gali pagreitinti gamybą. Kelių sluoksnių plokštės gamyba dažnai leidžia dizaineriams padaryti plokštę saugesnę ir efektyvesnę, o kiekviena projektavimo programa turi skirtingą didžiausių sluoksnių skaičių. Programa, kuri siūlo paprastą sekimą, gali neleisti dizaineriams padaryti didelių sekimo klaidų.
Plokštės gaminamos iš daug skirtingų dalių, o dalys, kurios tinka vienam poreikiui, gali netikti kitam. Kad dizaineriai galėtų gaminti plokštes bet kokiam tikslui, grandinių plokščių projektavimo programa turėtų turėti didelę dalių biblioteką. Tai leidžia vartotojams pasirinkti esamas plokštės dalis, kad būtų lengviau masinę gamybą. Projektavimo programa, kurioje taip pat yra atnaujinamas dalių sąrašas, leis vartotojams lengviau pritaikyti naujus komponentus.
Nors pagrindinės plokštės dalys dažniausiai yra pagrindinis rūpestis, pati plokštė dažnai neveiks be tinkamo programavimo. Programavimas gali būti pridedamas prie kiekvienos plokštės atskirai po gamybos, kuri gali veikti su nedideliu skaičiumi plokščių, tačiau greičiausiai tai neveiks su masinės gamybos plokštėmis. Kad tai būtų lengviau, plokštės projektavimo programa turėtų būti su duomenų importuotoju, kuris leistų vartotojams pridėti programavimą prieš gaminant.
Dauguma grandinių plokščių yra mažiausiai dviejų sluoksnių storio – vienas sluoksnis skirtas dalims, o kitas – saugai. Nors tai įmanoma, daugumai plokščių reikia daugiau sluoksnių, kad būtų galima pritaikyti daugiau dalių, kurios sustiprina blokus. Kiekviena plokštės projektavimo programa turi skirtingą didžiausių sluoksnių skaičių, todėl vartotojai turėtų pasirinkti programą, kurioje yra pakankamai sluoksnių, kad būtų sukurtas tinkamas dizainas.
Grandinės plokštės atsekimas yra svarbus žingsnis siekiant užtikrinti, kad plokštė veiktų po pagaminimo, nes jei atsekimas nebus atliktas, plokštė neveiks arba veiks tik iš dalies. Lengva sekimo funkcija parodys naudotojams, kurias dalis dar reikia atsekti, todėl jie nepamirš nė vienos dalies. Nors tai nėra būtina funkcija, tai siūlanti plokštės projektavimo programa gali apsaugoti vartotojus nuo brangiai kainuojančių klaidų.