Suvaldyti skausmą po šaknies kanalo gali būti sudėtinga; tačiau skausmą galima kontroliuoti vartojant nereceptinį analgetiką. Skausmo vaistai, kurie gali padėti, yra priešuždegiminiai vaistai, tokie kaip naprokseno natrio tabletės, ibuprofenas arba acetaminofenas. Šie preparatai taip pat padeda sumažinti patinimą, kuris dažnai lydi šaknies kanalą. Esant dideliam skausmui, odontologas gali paskirti stipresnius skausmą malšinančius vaistus.
Ledo paketo uždėjimas ant veido pusės taip pat gali padėti sumažinti skausmą po šaknies kanalo. Ledo šaltis taip pat gali padėti sumažinti patinimą, tačiau ledo negalima dėti tiesiai ant plikos odos, nes gali nušalti. Nors kai kurie gali siekti palengvėjimo ant žandikaulio uždėti kaitinimo pagalvėlę, tai nerekomenduojama. Šiluma gali sukelti audinių patinimą ir kartais pabloginti skausmą. Be to, kaitinimo pagalvėlės uždėjimas ant pažeistos vietos gali netgi paskatinti kraujavimą.
Acetaminofenas taip pat gali būti vartojamas po šaknies kanalo. Šį skausmą malšinantį vaistą dažnai renkasi žmonės, kurie negali vartoti vaistų nuo uždegimo dėl skrandžio dirginimo. Be to, acetaminofenas dažniausiai yra pasirinktas analgetikas žmonėms, kurie vartoja kraują skystinančius vaistus. Ibuprofenas ar kiti priešuždegiminiai vaistai gali sustiprinti kraują skystinančių vaistų ar antikoaguliantų poveikį ir sukelti sunkų ar nenormalų kraujavimą.
Kai skausmas po šaknies kanalo tampa stiprus arba netoleruojamas, odontologas gali rekomenduoti receptinius vaistus. Tai dažniausiai pasitaiko, kai nereceptiniai vaistai nepadeda numalšinti skausmo. Tam tikrų rūšių receptinių skausmą malšinančių vaistų, skirtų šaknies kanalams, yra kodeino, ir nors šie vaistai yra labai veiksmingi nuo skausmo, jie gali turėti pavojingą šalutinį poveikį. Receptinių vaistų nuo skausmo šalutinis poveikis gali būti ryškus mieguistumas, galvos svaigimas, vidurių užkietėjimas ir sumišimas.
Receptiniai vaistai, kurių sudėtyje yra kodeino, turėtų būti vartojami tik tuo atveju, jei skausmo negalima suvaldyti kitomis priemonėmis. Be to, jei pasireiškia šalutinis poveikis, reikia nedelsiant informuoti odontologą, kad jis galėtų rekomenduoti alternatyvų gydymą. Vaistai, kurių sudėtyje yra kodeino, yra narkotinės medžiagos ir, jei jie vartojami per daug arba ilgą laiką, gali sukelti priklausomybę.
Jei skausmas po šaknies kanalo nepraeina, pacientas turi pranešti savo odontologui, nes jis gali turėti infekciją. Dantų infekcija gali sukelti stiprų skausmą, o kai taip atsitinka, gali prireikti skirti antibiotikų. Pradėjus gydymą antibiotikais, pacientas gali pastebėti, kad jo skausmas žymiai sumažėjo. Nors skausmas gali palengvėti jau po vienos gydymo dienos, reikia suvartoti visus antibiotikus, kad infekcija ir skausmas nepasikartotų.