Organizacinės struktūros pokyčiai gali atsirasti dėl susijungimo ar įsigijimo, ekonominių pokyčių ir procesų pokyčių. Šie pokyčiai dažniausiai inicijuojami dėl organizacijos noro sumažinti išlaidas, tobulinti procesus ar padidinti komunikacijas. Įvykus susijungimui ar įsigijimui, įmonei gali tekti persitvarkyti, kad būtų išvengta procesų dubliavimo ir maksimaliai išnaudotos abiejų organizacijų stiprybės. Ekonominiai pokyčiai taip pat gali priversti keisti organizacinę struktūrą, siekiant pagerinti procesus ar sumažinti išlaidas. Proceso pokyčiai taip pat gali baigtis reorganizacija, kai įmonė nori tapti efektyvesnė arba pakeisti savo strateginę kryptį.
Susijungimai ir įsigijimai paprastai reikalauja, kad viena organizacija įsisavintų kitos organizacijos darbuotojus ir procesus. Ypač tuo atveju, kai abiejų organizacijų hierarchinės struktūros skiriasi, gali prireikti keisti organizacinę struktūrą. Naujoje organizacinėje struktūroje bus atsižvelgta į abiejų organizacijų stipriąsias puses, kad būtų maksimaliai išnaudotos sujungto verslo potencialas, taip pat sumažintos trūkumai, kuriuos bet kuri organizacija iškėlė į stalą. Jei jungiama ar įsigyjama įmonė išsaugos savo organizacinę struktūrą, kita organizacija vis tiek turi pasikeisti, kad galėtų stebėti abiejų organizacijų išteklius ir priimtus sprendimus.
Ekonominiai pokyčiai gali priversti keisti organizacinę struktūrą. Kai verslo ciklas panyra į nuosmukį ar depresiją, įmonės dažnai persitvarko, kad sumažintų išlaidas arba padidintų efektyvumą. Jei įmonė turi aukštą hierarchinę struktūrą, ji gali pastebėti, kad sprendimų centralizavimas gali padėti padidinti produktyvumą ir klientų pasitenkinimą, kartu mažinant darbuotojų kaitą. Kai kurios organizacijos šiame ciklo etape nusprendžia perduoti skyrius kitiems arba panaikinti tam tikrų pareigybių poreikį. Kai verslo ciklas yra plėtros fazėje, verslas gali pastebėti, kad organizacinės struktūros pokyčiai leidžia geriau paremti norą investuoti į tyrimų ir plėtros komandas arba padidinti produktų linijų skaičių.
Proceso pakeitimai gali pakeisti organizacijos struktūrą, pašalinant nereikalingus veiksmus arba pridedant naujų priemonių. Išanalizavus procesus organizacijoje, galima pastebėti, kad darbuotojai ar padaliniai iš esmės atlieka tas pačias užduotis. Siekiant pašalinti bet kokius procesų dubliavimus, darbuotojai ar skyriai gali būti perskirstyti arba iš viso pašalinti iš organizacinės struktūros. Įmonė taip pat gali pastebėti, kad trūksta esminių veiksmų, jie nėra priskirti asmeniui ar skyriui arba nebėra būtini. Tokiu atveju verslas būtų reorganizuojamas, kad būtų pritaikyti trūkstami žingsniai arba būtų užtikrinta, kad darbuotojai atliktų veiksmus pagal dabartinius tikslus ir uždavinius.