Juodi kojų nagai atsiranda dėl nago traumos. Dažniausios priežastys, dėl kurių kojų nagai pajuoduoja, yra netinkami batai, grybelis, daikto numetimas ant piršto ir per trumpas nago nukirpimas. Smūgis į kojų nagus sukelia kraujavimą po nago paviršiumi. Dalis arba visas kojų nagas gali pajuoduoti. Subungualinė hematoma yra medicininis terminas juodam kojų nagui, pažodžiui reiškiantis „kraujas po nagu“.
Sportininkai dažnai kenčia nuo juodų kojų nagų, ypač tie, kurie bėgioja ant kalvos ar žaidžia futbolą. Dėl to kalti batai, kuriuose nėra pakankamai vietos ilgiausiam pirštui, paprastai vieno miniatiūros ilgiui. Kai pirštas atsitrenkia į batą arba pėda slysta aplinkui, kraujas su kiekvienu žingsniu ar smūgiu stumiamas atgal po nagu. Sportininkai gali dėvėti kojines, kurios pašalina prakaitą, kad neslystų.
Nukirpus vidutinio ilgio nagus tiesiai, sumažėja įaugusių kojų nagų tikimybė, todėl nagai gali tapti juodi. Kai nago šonai įsiskverbia į odą, augant nagą dengia raukšlės. Prigludę batai taip pat gali sukelti įaugusius nagus. Slėgis gali sulaužyti odą, palikdamas ją atvirą infekcijai ir spalvos pasikeitimui dėl kraujo.
Kita juodų kojų nagų priežastis yra grybelis arba onichomikozė. Šis įprastas grybelis prasideda nuo baltų dėmių ir gali išsivystyti į storus, geltonus kojų nagus. Vėlgi, netinkamai prigludę batai įtrina nedidelius įtrūkimus į nagą, palikdami jį atvirą infekcijai dėl pėdų prakaitavimo. Šis grybelis, paprastai pažeidžiantis didįjį pirštą, daro spaudimą pirštui, sukeldamas skausmingą uždegimą.
Sportininkams gresia grybelis, nes jis klesti šiltuose, drėgnuose batuose. Pagyvenusiems žmonėms ir diabetikams taip pat gresia pavojus. Lengvas grybelis lengvai gydomas priešgrybeliniais, nereceptiniais geriamaisiais vaistais. Receptinius vietinius vaistus galima įsigyti už didesnę kainą, tačiau jie gali būti saugesnis pasirinkimas diabetikams, sergantiems vidutinio sunkumo. Labiau pažengusiais, pasikartojančiais atvejais gali prireikti gydymo lazeriu, kai lazeriu sunaikinami patogenai, kurie sukėlė infekciją.
Juodi kojų nagai dažniausiai yra nekenksmingi. Kartais, esant skausmingoms situacijoms, reikia nusausinti po kojų nagu esantį skystį arba pašalinti nagą. Tačiau dažnai juodi kojų nagai tiesiog nukrenta ir įauga naujas.
Retesnė nagų spalvos pakitimo priežastis yra melanoma. Piktybinė pėdos melanoma lengvai išgydoma, jei diagnozuojama anksti. Traumos atvejais spalvos pakitimas yra po nagu ir, augant, juda kartu su nagu. Jei nėra traumos ir nėra grybelio, podiatras turėtų įvertinti nagą netrukus po to, kai pasirodys spalva. Gydytojas gali paprašyti atlikti biopsiją, kad patvirtintų įtarimus.