Limfocitai šlapime rodo uždegimą, dažniausiai lėtinę būklę, pavyzdžiui, šlapimo pūslės akmenligę. Kitos priežastys gali būti susijusios su virusinėmis ligomis. Pacientams, kuriems persodintas inkstas, limfocitų buvimas šlapime rodo ankstyvas fiziologinio implantuoto organo atmetimo stadijas. Retai šlapimas, kuriame yra limfocitų, gali būti ankstyvas įspėjamasis šlapimo pūslės vėžio požymis. Dažniausia limfocitų priežastis šlapime yra bakterinė infekcija, pavyzdžiui, šlapimo takų infekcija.
Limfocitus gamina organizmo imuninė sistema kartu su vienu iš daugelio skirtingų baltųjų kraujo kūnelių tipų, vadinamų leukocitais. Šios mažos ląstelės skirstomos į du tipus – didelius granuliuotus limfocitus ir mažesnes agranuliuotas ląsteles. Daugelis granuliuotų limfocitų tipų vadinami „natūraliomis žudančiomis ląstelėmis“, nes šios ląstelės stebi ir naikina normalių ląstelių mutacijas, kurios gali susidaryti į navikus ar vėžį. Granuliuoti limfocitai apima „t ląsteles“ ir „b ląsteles“, kurios yra mažesni baltieji kraujo kūneliai, kurie klajoja kraujotakos sistemoje, ieško ir naikina įsiveržusius patogenus.
Limfocitų buvimas šlapime paprastai paneigia pagrindinę sveikatos būklę, nes limfocitai gausiai dauginasi, kai organizme vyksta ląstelių mutacijos arba įsiveržia patogenai. Šie limfocitai galiausiai išsiskiria iš organizmo su šlapimu. Daugeliu atvejų limfocitai šlapime rodo tam tikrą bakterinę ar virusinę infekciją. Priklausomai nuo būklės ir priežasties, infekcija gali būti nedidelė arba rimta. Norint nustatyti tikslų limfocitų tipą šlapime ir padidėjusios limfocitų gamybos priežastį, dažniausiai reikalingas mikroskopinis laboratorinis tyrimas.
Limfocitų skaičius po operacijos gali būti didelis, o tai rodo infekciją ar vidinius pažeidimus. Retais atvejais limfocitų susidarymas šlapime gali būti pakankamai stiprus, kad šlapimas būtų pieno spalvos, vadinamas chilurija. Chiluriją gali sukelti tuberkuliozė arba parazitinė infekcija atogrąžų klimate. Išsivysčiusiose šalyse chilurija gali atsirasti dėl traumų, inkstų pažeidimų, nėštumo ar limfinės sistemos pažeidimo, nors ši būklė yra labai reta. Tokios infekcijos lengvai išgydomos poilsio ir antibiotikų režimu.
Rimčiau, padidėjęs limfocitų kiekis šlapime gali rodyti šlapimo pūslės akmenis arba šlapimo pūslės vėžį. Kai kuriuos limfocitus gamina kaulų čiulpai, o tai reiškia, kad limfocitų padidėjimas gali būti ankstyvas įspėjamasis leukemijos – kaulų čiulpų ir kraujo ląstelių vėžio – požymis. Sėkmingas vėžio gydymas priklauso nuo ankstyvo vėžio nustatymo, todėl medicinos specialistas gali paskirti laboratorinius tyrimus, kad nustatytų, kokio tipo limfocitų yra daug. Limfocitų tipas šlapime paprastai yra infekcijos tipo rodiklis, nes kai kurie limfocitai gausiai dauginasi, kai nustato tam tikras sąlygas. T ir B limfocitų ląstelės dažniausiai rodo virusinę ar bakterinę infekciją, o granuliuotos natūralios žudančios ląstelės rodo vėžinių ląstelių buvimą organizme.