Terminą „alopatija“ kai kurie alternatyviosios medicinos gydytojai vartoja apibūdindami žmones, kurie praktikuoja tradicinę arba „vakarietišką“ mediciną. Kadangi šis žodis iš esmės buvo sukurtas kaip epitetas įžeidinėti tradicinius gydytojus, retai galima pamatyti eilinius gydytojus, vadinančius save alopatais. Kai kurie gydytojai taip pat atmeta šio termino vartojimą, nes mano, kad tai nebėra tinkamas medicinos praktikos apibūdinimas.
Samuelis Hahemannas, homeopatijos įkūrėjas, sugalvojo terminą „alopatija“. Jis kilęs iš graikiškų šaknų ir apytiksliai verčiamas kaip „priešinga kančia“. Jis naudojo šį žodį apibūdindamas dažnai griežtus ir kartais beprasmiškus gydymo būdus, kuriuos XIX amžiuje taikė įprasti gydytojai. Daugelis praktikų rėmėsi „humoro“ teorija, kilusia iš senovės graikų, ir tikėjo, kad sveikatos būklėms būdingas tam tikro humoro perteklius arba trūkumas. Humoro pusiausvyrai atkurti buvo naudojami kraujo nuleidimai, taurelės ir daugybė kitų metodų, o Hahemannas manė, kad šios praktikos buvo barbariškos.
Hahemannas taip pat norėjo aiškiai atskirti homeopatiją nuo tradicinės medicinos praktikos. Jis teigė, kad alopatija apima ligos simptomų, o ne pagrindinės būklės priežasties gydymą. Alopatinio gydymo tikslas buvo sukelti simptomus, kurie pašalintų simptomus, bet nebūtinai pasiektų problemos esmę. Kita vertus, homeopatija buvo gydymas, pritaikytas kiekvienam pacientui, sutelkiant dėmesį į visą kūną, o ne į abstrakčius simptomus.
Nors tradicinė medicina kažkada nusipelnė alopatijos etiketės, daugelis gydytojų mano, kad tai nebėra. Pavyzdžiui, gydytojai osteopatai taiko visą kūną apimantį požiūrį į mediciną, o jų kvalifikacija yra beveik tokia pati, kaip ir įprastų gydytojų. Daugelis gydytojų taip pat pripažįsta, kad vertinant paciento sveikatą ir poreikius svarbu žiūrėti į visą kūną, o šiuolaikinis gydymas yra orientuotas į bendrą savijautą, o ne tik reaktyvų atsaką į ligos simptomus.
Šį terminą vartojantys žmonės kartais praranda neigiamą poveikį. Kai kurie alternatyvūs gydytojai, kalbėdami su klientais, kalba apie alopatiją aštriais tonais, kad pabrėžtų jų siūlomų gydymo būdų vertę. Tačiau kiti alternatyviosios medicinos specialistai vengia šio termino, nes pripažįsta, kad yra daug požiūrių į mediciną, o kai kurie netgi dirba kartu su įprastiniais gydytojais. Pavyzdžiui, chiropraktikas gali dirbti su stuburo specialistu, kad gydytų ir išvengtų nugaros traumų.