Kas yra aminoacilo tRNR?

Aminoacilo pernešimo ribonukleorūgštis (aminoacilo tRNR) naudojama verčiant mRNR sekas į baltymus. Aminoacilo tRNR susideda iš RNR grandinės, kurią sudaro trijų nukleotidų grupė, vadinama kodonu, sujungta su aminorūgštimi. Kiekvienas kodonas yra suporuotas su konkrečia aminorūgštimi, nors yra tam tikras perteklius; kai kurios aminorūgštys yra suporuotos su keliais kodonais. Ši tRNR forma padeda pernešti aminorūgštis į ribosomą, kur vyksta transliacija, o tRNR kodonas vėliau susiporuoja su komplementaria seka mRNR grandinėje, leidžiančia jai gimininga aminorūgštimi prisijungti prie transliacijos metu susidariusios polipeptidinės grandinės. Šio proceso metu genetinė informacija, kuri iš pradžių buvo tRNR grandinėje, gali būti paversta aminorūgštimis, kurios naudojamos baltymams formuoti.

Po to, kai tRNR molekulės yra perrašomos iš jas koduojančios DNR sekos, vyksta dviejų etapų procesas, skirtas šios tRNR grandinės paversti aminoacilo tRNR molekulėmis. Šios reakcijos vyksta tam tikros aminorūgšties specifiniame aminoacilo tRNR sintetazės fermente. Iš viso yra 20 šių fermentų tipų, po vieną kiekvienai aminorūgščiai.

Iš pradžių turi būti suaktyvinta aminorūgštis, kuri turi būti suporuota tRNR sekai. Tai pasiekiama adenilinant aminorūgštį arba sujungiant ją su adenozino monofosfato (AMP) molekule energijos suvartojančioje reakcijoje. Tada tRNR pereina į aminorūgšties-AMP kompleksą ir pašalina AMP, kad prisijungtų prie aminorūgšties. Šioje reakcijoje esantis AMP gaunamas iš adenozino trifosfato (ATP), kuris virsta AMP ir pirofosfato molekule, kuri suteikia energijos šiai reakcijai.

Aminoacilo tRNR sintetazės fermentai yra makromolekulės, kurios atpažįsta, kurios tRNR sekos keliais skirtingais būdais susieja su reikiama aminorūgštimi. Fermentai turi savo tRNR antikodono sritis, kurios gali atpažinti tRNR kodonų sekas. Be to, fermentas gali atpažinti akceptoriaus vietas tRNR sekose, kurios yra abiejuose molekulių galuose.

Šios kelios atpažinimo vietos užtikrina, kad aminorūgštys būtų suporuotos su teisingomis tRNR sekomis ir yra ypač svarbios tokioms aminorūgštims kaip serinas, kurios gali atitikti šešis skirtingus tRNR kodonus. tRNR sekose taip pat yra genetinės informacijos, išskyrus kodono ir akceptoriaus vietas. Aplink kodoną yra diskriminacinės bazės, kurios neleidžia netinkamam aminoacil-tRNR sintetazės fermentui jį paimti ir panaudoti reakcijoje.