Antigeno ir antikūno surišimas įvyksta, kai antikūnas pritraukiamas prie antigeno ir prie jo prisijungia. Kai jis yra prijungtas, antikūnas sukuria cheminę reakciją, kuri galiausiai sukels antigeno sunaikinimą. Tik specifiniai antikūnai gali prisijungti prie skirtingų tipų antigenų, nors panašios struktūros antigenus gali atakuoti tie patys antikūnai. Antigeno ir antikūno ryšys yra grįžtamasis, todėl antikūnas turi bandyti užmegzti kelis ryšius su antigenu, kad išliktų susijęs, kol pašalins antigeną.
Yra daug skirtingų antigenų tipų, nors dauguma yra baltymų antigenai, kurie gali pritraukti antikūnus. Daugelis antigenų, tokių kaip virusai ir bakterijos, yra kenksmingi, o kiti, tokie kaip žiedadulkės ar kiti alergenai, patys yra nekenksmingi. Antikūnai, dalyvaujantys surišant antigenus ir antikūnus, yra žinomi kaip imunoglobulinai. Tai molekulės, kurias gamina organizmo imuninė sistema, siekdama sunaikinti svetimkūnius.
Imunoglobulinai gali turėti didelį arba mažą afinitetą tam tikriems antigenams. Kai afinitetas yra didelis, antigeno ir antikūno surišimas yra stiprus. Šis stiprus ryšys tarp imunoglobulino ir antigeno leidžia imunoglobulinui pradėti cheminių reakcijų kaskadą, kuri galiausiai suskaido ir sunaikina antigeną.
Net jei antikūno afinitetas antigenui yra labai didelis, antigeno ir antikūno jungimasis nėra nuolatinis. Antigenas gali nutraukti ryšį su antikūnu, apsigindamas nuo jo atakos. Kad tai būtų išvengta, antikūnas turi bandyti prisijungti prie antigeno per daugybę skirtingų jungčių.
Antigeno ir antikūnų jungimasis paprastai priklauso nuo silpnų elektros krūvių panaudojimo, kad antigenas ir antikūnas būtų sujungti. Elektronų giminingumas vienoje jungties pusėje ir nedidelis neigiamas krūvis kitoje yra dažniausia šių dviejų tipų molekulių surišimo priežastis. Ryšių tipai, laikantys molekules kartu, gali būti hidrofobiniai, elektrostatiniai arba vandeniliniai ryšiai arba Van der Waals jėgos.
Visas antigenų ir antikūnų jungimasis yra nekovalentinis, o tai reiškia, kad jie nesidalija elektronais. Jie išlieka atskiros molekulės, net kai yra surištos. Tai reiškia, kad kai jie išsiskiria, kiekvienas iš jų yra nepažeistas.