Antikūnų aptikimas yra svarbus medicinoje nustatant ligas, nes antikūnai yra dideli baltymai, galintys aptikti virusus ir bakterijas. Antikūnų aptikimas atliekamas laboratorijose ir lauke, siekiant ištirti antikūnų ir antigenų ryšius ir identifikuoti antikūną pagal konkretų jo spalvos pasikeitimą, kai su fermentu reaguojanti substrato molekulė yra prijungta prie jo, kol ji vis dar yra surišta su antigenu. Aptikimo testas žinomas kaip su fermentais susijęs imunosorbentinis tyrimas (ELISA). Iki ELISA sukūrimo vieninteliai tyrimai buvo radioimuniniai tyrimai, kuriais septintajame dešimtmetyje buvo nustatyti antikūnai pagal jų specifinį radioaktyvumą. Aštuntojo dešimtmečio pradžioje buvo sukurti keli ELISA metodai specifiniams antikūnams nustatyti.
Netiesioginis sumuštinis ELISA antikūnų aptikimo metodas paruošia buferinį tirpalą, kuriame yra ligos antigeno, ir suriša jį su plastikine plokštele. Tada įvedamas pirminis paciento antikūnas, kuris prisijungtų prie antigeno. Tada įvedamas antrinis antikūnas su prijungtu fermentu ir pridedamas fermento substratas. Tai sukelia reakciją, kuri pakeičia fermento spalvą, signalizuojant, kad du antikūnai susijungė, jei paciento antikūnas yra teigiamas to ligos antigeno atžvilgiu. Spalvos pasikeitimo stiprumas rodo antikūno aptiktos ligos kiekį; tada šis spalvos stiprumas kiekybiškai išmatuojamas spektrometru.
Kitas ELISA metodas, tinkamas, kai pacientų mėginiai yra neapdoroti arba nešvarūs, yra konkurencinė ELISA, kai nepažymėtas antikūnas yra inkubuojamas su paciento antigeno mėginiu. Surištas antikūno/antigeno kompleksas nuplaunamas taip, kad nesusijungęs antikūnas būtų pašalintas, o antrinis antikūnas, susietas su pirminiam antikūnui būdingu fermentu, įvedamas, kad prisijungtų prie antigeno. Į fermentą pridėjus substrato, jei ligą aptinka antikūnas, fermentas kaip signalą sukurs chromogenines arba fluorescencines savybes. Izraelio gydytojų atliekamuose lauko tyrimuose naudojamas mėgintuvėlis, pilnas baltymų fragmentų ir antikūnų, ir mėlynas skystis. Jei mėlynas skystis per dešimt minučių pasidaro raudonas, konkretų antigeną mėgintuvėlyje atpažįsta tos konkrečios ligos antikūnas.
Sunkiai pasiekiamose besivystančių šalių vietose laboratorijos nėra lengvai prieinamos. Daug komercinių antikūnų aptikimo rinkinių buvo parduota sveikatos priežiūros specialistams tuberkuliozės, ypač vaikų ir žmogaus imunodeficito viruso / autoimuninio deficito sindromo (ŽIV/AIDS) susijusios tuberkuliozės, tyrimui. Vienas tyrimas, apimantis 68 specifinius tyrimus, parodė, kad šie rinkiniai nebuvo tokie patikimi kaip skreplių tepinėlių mikroskopija.
Maliarija yra dar viena liga, kurios antikūnams nustatyti naudojama fluorescencinių antikūnų tyrimo procedūra. Ši procedūra tinkama tikrinant kraujo donorus, nes perpylimo sukelta maliarija gali nepasireikšti atliekant paprastą kraujo plėvelės tyrimą. Jei pacientui kartojasi neigiami kraujo mėginiai, tačiau pasireiškia stiprūs ligos simptomai, tai gali atskleisti fluorescencinio žymens testas. Tiriant mikroskopu, maliarijos antikūnai dažnai būna obuolių žalios spalvos, kuri yra teigiama maliarijos parazitui.