Centrinis procesorius (CPU) yra kompiuterio smegenys. Jis tvarko visus sistemos skaičiavimus vienu metu atlikdamas vieną aritmetinį skaičiavimą: sudėtį, atimtį, daugybą ar padalijimą. Atmega128® yra mikrovaldiklio blokas, kuris naudoja maždaug 1 milijono instrukcijų per sekundę (MIPS) greitį vienam megahercui (MHz). Tai reiškia, kad veikdamas 1.0 MHz dažniu, lustas kas sekundę gali apskaičiuoti maždaug vieną milijoną aritmetinių sprendimų.
Be neapdoroto laikrodžio greičio, procesorius yra niekas be atminties. Nesant galimybės saugoti apskaičiuotų duomenų, sprendimai būtų akimirksniu prarasti. „Atmega128®“ turi 128 kilobaitus integruotos „flash“ atminties, be to, jame yra keturi kilobaitai elektroninės ištrinamos programuojamos tik skaitymo atminties (EEPROM). EEPROM saugo kompiuterio, prie kurio prijungtas lustas, dvejetainės įvesties išvesties sistemos (BIOS) informaciją. BIOS veikia kaip žemo lygio operacinė sistema, valdanti prie sistemos prijungtą aparatinę įrangą.
Atmega128® prijungiamas prie pagrindinės plokštės kompiuterinėje sistemoje. Jei procesorius yra sistemos smegenys, pagrindinė plokštė yra stuburas: su juo jungiasi visi kompiuterinės sistemos komponentai. Atmega128® jungiasi prie pagrindinės plokštės per 64 kontaktų jungtį. Tai reiškia, kad Atmega128® yra suderinamas tik su pagrindinėmis plokštėmis, kurios palaiko šį 64 kontaktų ryšį.
Kaip ir visiems elektroniniams prietaisams, „Atmega128®“ darbui reikalingas nuolatinis energijos antplūdis. Jis veikia nuo 4.5 iki 5.5 voltų įtampa. Kompiuterio maitinimo šaltinis suteikia šią galią, o procesoriaus lusto EEPROM saugoma sistemos BIOS nustatyta informacija nustato konkrečią įtampos reikšmę.
Maksimalus Atmega128® mikroprocesoriaus veikimo dažnis yra 16MHz. Vėlgi, specifinis lusto greitis paprastai nustatomas per įrenginio BIOS. Apskritai, kuo greičiau veikia lustas, tuo daugiau energijos ir šilumos ji gamina. Esant visu 16MHz greičiui, Atmega128® galės vykdyti 16 milijonų instrukcijų per sekundę.
Kiekvienas procesoriaus lustas turi ne tik tam tikrą įtampos lygį, bet ir tam tikrą darbinę temperatūrą. Žemesnė nei minimali temperatūra neleis elektroniniams signalams tekėti per lustą, o aukštesnė nei maksimali temperatūra iškraipys pačią lustą, todėl signalai negalės praeiti. Atmega128® diapazonas yra nuo -40 iki 85 laipsnių Celsijaus (nuo -40 iki 185 Farenheito). Tačiau, kaip ir visos elektronikos atveju, paleidimas labiau link apatinės tos skalės dalies pailgins lusto naudojimo laiką.