Šaknis yra tam tikros rūšies šaknų struktūra, esanti kai kuriuose augaluose, kuriai būdinga tai, kad ji yra gana didelė ir patenka tiesiai į žemę. Šios konstrukcijos šaknys, besileidžiančios žemyn, išauga ir veikia kaip tam tikras kamienas po žeme. Augalus, kurių šaknys yra šaknys, galima palyginti su augalais, kurių šaknų sistema yra pluoštinė.
Yra keletas būdų, kaip šaknis gali būti naudingas augalui. Vienas iš svarbiausių yra tai, kad jis leidžia augalui gana toli pasiekti žemyn, kad surastų vandens, kad galėtų išsilaikyti. Sausesnio klimato sąlygomis arba vietose, kur vanduo linkęs tekėti giliai, tai gali būti nepaprastai naudinga. Iš tiesų, daugelis dykumos augalų turi neįtikėtinai gerai išvystytą šaknų sistemą, leidžiančią jiems išgyventi net ir pačiu sausiausiu klimatu. Pavyzdžiui, meskitai prisitaikė išgyventi Mohave dykumoje, todėl sugalvojo daug biologinių priemonių, padedančių jiems pasiekti ir išsaugoti vandenį, įskaitant šaknis, kurios gali siekti daugiau nei 80 pėdų (25 m).
Daugelyje augalų ši šaknų struktūra taip pat gali veikti kaip maisto ir vandens rezervuaras. Jis gali augti labai plačiai ir išlikti gana apsaugotas po žeme, todėl augalas gali sutaupyti energijos, kai jos gali prireikti, pavyzdžiui, auginant sėklas. Daugelį augalų, kurie savo šakniavaisį naudoja kaip maisto šaltinį, valgo ir žmonės, o vadinamosios šakninės daržovės paprastai yra tokios šaknies struktūros augalai. Morkos, ropės, ridikai, pastarnokai, jicama ir varnalėšos yra dažniausiai valgomų augalų pavyzdžiai, kur pagrindinė valgoma augalo dalis yra pati šaknis.
Paprastai šie maisto produktai yra ne tik pakankamai maistingi, bet ir itin drėgni, nes dėl vandens pertekliaus, kurį augalas juose kaupė. Nesunku įsivaizduoti bet kurį iš aukščiau pateiktų pavyzdžių kaip vandens saugojimo įrenginius. Tiesą sakant, kai kurie augalai, pavyzdžiui, jicama, atrodo beveik kaip kieto vandens formos, vandens kiekis yra toks didelis.
Tiek šaknų sistema, tiek pluoštinė šaknų sistema prasideda kaip tos pačios rūšies šaknys ir šiek tiek keičiasi augalo vystymuisi. Pirmoji šaknis, kurią augalas išsiunčia, vadinama radikalu. Šaknų sistemoje šakniastiebiai toliau stumiasi žemyn ir išauga, o kartais išskirdami mažas šakeles. Kai kuriais atvejais šios šakos beveik nebus matomos, kaip žino visi, kurie matė morką ar ropę ką tik iš žemės. Kita vertus, pluoštinėje šaknų sistemoje šaknys ilgainiui nukris, o ją pakeis mažesnių šaknų tinklas.
Dėl šaknų šaknų dydžio ir gylio jas turinčius augalus gali būti ypač sunku išbristi iš žemės. Persodinti augalus su tokio tipo šaknimis yra sunkiau nei augalus su pluoštine šaknų sistema, o daugeliu atvejų tai beveik neįmanoma. Taip pat gali būti sunku visiškai pašalinti augalus su šaknimis, nes ištraukti visos šaknų sistemos gali būti neįmanoma. Tai dažnai pastebima su kiaulpienėmis, kurių šaknys yra labai ilgos ir tvirtos. Žmonės greitai pastebi, kad bandant ištraukti kiaulpienes, kad jas būtų galima išimti iš sodo, atrodo, kad jos metai iš metų atauga. Taip yra todėl, kad dalis šaknies liko žemėje ir iš jos ilgainiui išauga naujas augalas.