Bakterijų fiziologija yra struktūrų ir funkcijų, leidžiančių bakterijoms išgyventi, tyrimas. Tai apima viską, nuo bakterijų ląstelių sienelių sudėties iki fermentų, kuriuos jos gali gaminti įvairioms vidinėms ir išorinėms funkcijoms atlikti. Šios srities mokslininkai gali dirbti laboratorinėje aplinkoje, tirdami žinomus organizmus ir daugiau sužinoti apie naujas bakterijas. Farmacijos įmonės, aplinkosaugos agentūros ir daugelis kitų organizacijų naudojasi bakterijų fiziologais.
Bakterijos yra labai įvairios, o dalis bakterijų fiziologijos darbo apima prasmingų kategorijų kūrimą, siekiant jas suskirstyti į klasifikavimo ir tyrimų tikslus. Pavyzdžiui, mokslininkai gali padalyti organizmus į gramteigiamas ir neigiamas bakterijas pagal tai, kaip jie reaguoja į gramo dėmę. Taip pat jas galima suskirstyti į anaerobines bakterijas, kurioms išgyventi nereikia deguonies, aerobines bakterijas ir organizmus, kurie gali keistis pirmyn ir atgal ir kuriems nereikia išskirtinai deguonies prisotintos ar deguonies turinčios aplinkos. Bakterijos taip pat gali turėti skirtingą judrumo laipsnį ir kitas savybes, kurios gali padėti tyrėjams jas atpažinti.
Bakterijų fiziologijos mokslininkai nagrinėja bakterijų genetiką ir tai, kaip bakterijos reaguoja į evoliucinį spaudimą. Jie seka ir tiria bakterijų gaminamus fermentus. Tai apima struktūras, būtinas ląstelių funkcijoms, tokioms kaip dalijimasis, ir bakterijų fermentus, kurie gali būti išleisti į supančią aplinką. Kai kurie iš jų yra toksiški ir gali turėti įtakos bakterinėms infekcijoms ir užteršimui. Kai kurie daugiausia dėmesio skiria infekcinėms ligoms ir bakterijų bei kitų organizmų sąveikai.
Kiti tyrinėtojai gali tyrinėti tokias temas kaip simbiozė, kai bakterijos gyvena kartu arba su kitais organizmais, siekdamos abipusės naudos. Pavyzdžiui, kai kuriose kerpėse bakterijos yra simbiotinės partnerės, kurios aprūpina organizmą energija, kad jis galėtų augti ir daugintis. Kitos bakterijos gali parazitiškai gyventi ant kitų organizmų ir gali pasikliauti jomis mitybai. Kai kurie iš šių parazitų teikia naudos mainais, pavyzdžiui, virškinamajame trakte esantys organizmai, kurie padeda virškinti, o kiti gali pakenkti savo šeimininkams ir sukelti ligas.
Studentai, besidomintys bakterijų fiziologija, turės lankyti biologijos kursus ir mokytis būtent apie bakterijas. Daugelis šios srities žmonių turi aukštuosius laipsnius ir mokslinių tyrimų kreditus. Įsidarbinimo perspektyvos yra gana įvairios. Vieta, kurioje mokslininkas nori dirbti, gali turėti įtakos, kaip ir specialybės sritis. Tyrėjai, dirbantys tokiomis temomis kaip bakterijų naudojimas vaistų gamybai, gali uždirbti daugiau nei, pavyzdžiui, žmonės, atliekantys pagrindinius bakterijų fiziologijos tyrimus.