Bakterijų plazmidė yra bakterijos viduje esanti DNR grandinė, nepriklausoma nuo bakterijos chromosomų DNR. Plazmidės gali daugintis pačios ir gali būti perduodamos tarp organizmų, o tai yra svarbi bakterijų savybė, nes jos naudoja plazmides genetinės informacijos perdavimui viena kitai. Šis gebėjimas taip pat tampa svarbus mokslininkams, kurie naudoja bakterines plazmides kaip vektorius svetimos DNR įterpimui į tiriamą DNR.
Plazmidės struktūra dažnai yra dvigrandė ir apskrita. Jame gali būti įvairaus ilgio genetinės informacijos ir yra keletas skirtingų plazmidžių rūšių, kurios gali atlikti skirtingas funkcijas. Kai kurios, pavyzdžiui, gali atlikti konjugaciją, prisijungdamos prie kitos bakterijos, kad perduotų genetinę informaciją. Kiti turi genetinę informaciją, kuri suteikia atsparumą antibiotikams, padeda bakterijoms suskaidyti maistines medžiagas, kad jos būtų prieinamos, arba padaro bakteriją virulentiška. Šios plazmidės negali konjuguoti pačios; jiems reikia konjuguojančios plazmidės pagalbos.
Genų perkėlimas tarp bakterijų per bakterinę plazmidę yra patrauklus būdas, leidžiantis šiems organizmams perkelti genetinę medžiagą horizontaliai, o ne apsiriboti jos perdavimu iš kartos į kartą. Tai yra viena iš priežasčių, kodėl bakterijos galėjo taip ilgai klestėti, nes jos gali itin greitai prisitaikyti prie savo aplinkos. Pavyzdžiui, jei įvedamas antibiotikas, bakterijos su plazmidėmis, kurios padeda joms atsispirti tam antibiotikui, gali perduoti tas plazmides kitoms bakterijoms.
Genetikos tyrinėtojai naudojasi plazmidė kaip idealiu vektoriumi DNR pernešimui tyrimų tikslais. Jie naudoja konjuguojančią plazmidę, skirtą genetinei medžiagai perkelti, ir į plazmidę įterpia pasirinktą DNR, kad ji būtų perkelta. Tada jie įveda bakterinę plazmidę į ląstelių kultūrą, leidžiančią ląstelėms užsikrėsti, taip sakant, nauja genetine medžiaga, kuri vėliau bus atkurta, kai ląstelės dalijasi.
Dėl plačiai paplitusio plazmidžių naudojimo genetiniams tyrimams, daugelis laboratorijų gali generuoti plazmides tyrimams pagal užsakymą. Mokslininkai gali užsisakyti bakterinę plazmidę vienoje iš šių laboratorijų, o laboratorija įterps tikslinę DNR ir supakuosis naudoti bakterinę plazmidę. Kitais atvejais tyrėjai gali pageidauti paruošti savo plazmides tyrimams dėl įvairių priežasčių – nuo noro kontroliuoti eksperimento sąlygas iki susirūpinimo dėl tiriamos DNR saugumo.