Banginių apsauga apima ne tik banginių, bet ir delfinų, jūrų kiaulių ir kitų banginių šeimos gyvūnų apsaugą. Pagrindinė problema, kurią sprendžia banginių apsaugos aktyvistai, yra per didelė medžioklė. Buvo priimti įvairūs įstatymai, kurie baigėsi tuo, kad komercinė medžioklė tapo neteisėta. Tačiau yra bendruomenių, kurioms šis draudimas nebuvo taikomas, suprasdamos, kad jos neviršija kvotos. Banginių apsauga taip pat apima jūros vandens kokybės išsaugojimą, o įmonėms draudžiama išmesti savo pramonines atliekas į vandenyną.
Banginių apsaugos idėja iš pradžių kilo dėl to, kad žvejai banginius medžiojo pernelyg agresyviai ir dėl to banginių populiacija smarkiai sumažėjo. Nors praėjusio amžiaus ketvirtajame dešimtmetyje vyriausybės buvo susitarusios dėl medžioklės mažinimo, šios priemonės paprastai buvo neveiksmingos, nes daugeliui bendruomenių vis dar reikėjo didelių laimikių, kad išliktų. 1930 m. buvo įkurta Tarptautinė banginių medžioklės komisija (IWC), kurios tikslas buvo reguliuoti banginių medžioklės pramonę apribojant banginių, kuriuos galima sugauti tam tikrais sezonais, skaičių.
Tačiau net IWC sukūrimas nebuvo veiksminga banginių apsaugos priemonė. Sritys, kurias labiausiai paveikė IWC taisyklės, lėtai atitiko taisykles. Buvo nustatyta, kad dauguma banginių medžioklės rajonų iš tikrųjų pateikė IWC klaidingus sugavimo įrašus. Dėl to IWC nusprendė atlikti visišką reguliavimo peržiūrą, uždraudusią komercinę banginių medžioklę 1982 m.
Tačiau yra komercinės banginių medžioklės draudimo išimčių. Tam tikroms bendruomenėms leidžiama gaudyti banginius, nes visiškai uždraudus šią praktiką šiose vietose gali atsirasti badas. Tokioms vietovėms kaip Grenlandija, Sibiras ir Aliaska suteikiama tam tikra banginių kvota, kurią jiems leidžiama sugauti išgyvenimo tikslais.
Tačiau banginių apsaugos procesas nesibaigia komercinės medžioklės prevencija. Banginiai ir delfinai yra labai paveikti jūros taršos. Įvairios gamybos įmonės kaltos dėl atliekų išmetimo į jūrą. Į jūrą išmetamų atliekų pavyzdžiai yra cheminės medžiagos, nuotekos, nafta ir net branduolinės medžiagos.
Ši tarša daro įtaką vandens kokybei, o tai savo ruožtu kenkia vandenyne gyvenantiems vandens gyvūnams. Delfinai ir banginiai, kurie vandenyje yra veikiami sunkiųjų metalų, gali mirti apsinuodiję. Nustatyta, kad žmonėms, valgantiems banginių šeimos gyvūnus, gali kilti apsinuodijimo švinu ir kitų problemų, susijusių su užterštu vandeniu, pavojus.