Baptistų teologija apima daug pagrindinių įsitikinimų, kuriais dalijasi dauguma krikščionių grupių visame pasaulyje, pavyzdžiui, Jėzaus Nazareto viešpatavimas; jo gimimas, mirtis ir prisikėlimas; ir kad jis kada nors grįš teisti pasaulio. Kiti tikėjimai, labiau būdingi baptistų bažnyčiai, apima tikinčiojo krikštą, išganymą malone per tikėjimą, visų tikinčiųjų kunigystę ir bažnyčių autonomiją. Kadangi baptistų bažnyčia neturi valdymo organo ar bažnyčios hierarchijos, šie įsitikinimai įvairiose bažnyčiose gali labai skirtis.
Nors daugelis narių teigia, kad baptistų bažnyčia gyvuoja nuo Biblijos laikų, kiti tvirtina, kad jie yra protestantų grupė, atskirta nuo anabaptistų ar separatistų kažkada XV amžiuje. Šiaip ar taip, baptistų bažnyčios iki 15 m. buvo išplitusios Europoje ir kolonijinėje Amerikoje. Nuo to laiko baptistų teologija suskilo į daugelį krypčių, todėl susidarė tokios grupės kaip Jungtiniai baptistai, Laisvos valios baptistai, Pietų baptistai ir daugelis kitų.
Krikštytojai savo vardą gavo iš vieno iš pagrindinių savo įsitikinimų, žinomo kaip tikinčiųjų krikštas. Užuot krikštijusius kūdikius, gimusius bažnyčios nariams, bažnyčios siūlo krikštą visiems, kurie tiki ir išpažįsta, kad Jėzus yra Viešpats. Be to, krikštas atliekamas panardinant, o ne apšlakstant vandeniu ant galvos.
Kitas baptistų teologijos aspektas yra žinomas kaip išganymas malone per tikėjimą. Tai reiškia, kad visi žmonės nusidėjo ir jiems reikia išgelbėjimo, bet negali nieko padaryti, kad išsigelbėtų. Vietoj to, Dievas gelbsti žmones savo malone, jei tik jie juo tiki.
Baptistų teologija taip pat apima sąvoką, vadinamą tikinčiųjų kunigyste. Biblija laikoma vienintele dvasine valdžia, todėl kiekvienas gali skaityti Bibliją ar melstis be kunigo, pamokslininko ar pastoriaus pagalbos. Nors ganytojai ir diakonai yra labai gerbiami, nariai raginami studijuoti Bibliją ir išsiaiškinti, ar pastoriaus pamoka atitinka Šventąjį Raštą.
Dėl tikinčiųjų kunigystės baptistų bažnyčios yra savarankiškos. Nėra bažnyčios hierarchijos, kuri nulemtų, kaip viskas turi būti daroma; Vietoj to, daugumą baptistų bažnyčių pirmiausia valdo išrinkti diakonai arba visos bažnyčios balsai. Šis lokalizuotas sprendimų priėmimas lemia skirtingus įsitikinimus ir praktiką įvairiose baptistų bažnyčiose.
Nepaisant to, daugelis bažnyčių jungiasi į bendrystę ir misionieriškas pastangas tokiose grupėse kaip Pietų baptistų konvencija ir Pasaulio baptistų aljansas. Nors šios grupės neturi jokios valdžios jokios bendruomenės atžvilgiu, grupės bažnyčios paprastai būna panašios. Todėl bažnyčios dažnai identifikuojamos pagal jų susitarimą ar asociaciją.