cDNR mikrogardelė yra būdas išsiaiškinti, kurie genai ląstelėje yra aktyvūs bet kuriuo metu. Tai naudinga norint atskirti genus, kurie skirtingų tipų ląstelėse veikia skirtingai, ir kurie genai yra aktyvūs tam tikromis sąlygomis, pavyzdžiui, vėžiu. Pavadinimas cDNR kilęs iš mažų dezoksiribonukleino rūgšties (DNR) sekų, kurios prilimpa prie ląstelių ekspresuojamų ribonukleino rūgšties (RNR) sekų. Šios mažos DNR sekos papildo (c) RNR sekas, taigi ir lipnumą, taip pat yra pažymėtos fluorescencinėmis žymėmis, todėl eksperimentuotojas gali matyti, kurios RNR sekos yra išreikštos ir kokiu mastu.
Ląstelėse yra DNR kaip visų ląstelei reikalingų baltymų planas. DNR seka atspindi aminorūgštis, kurias organizmas turi surinkti ir sujungti, kad susidarytų baltymas. Tarp DNR ir baltymų gamybos yra tarpinis etapas. Ląstelė nukopijuoja geno seką į kitą formą, vadinamą pasiuntinio RNR (mRNR). Tada ląstelės mechanizmas nuskaito mRNR kaip norimo baltymo instrukcijas.
Kadangi tam tikrų genų mRNR nėra nuolat ekspresuojama, genetikai gali pažvelgti į tai, kas išreiškiama tam tikromis sąlygomis. Vienas naudingas būdas yra palyginti naviko ląsteles su sveikomis ląstelėmis ir pamatyti, kurie genai skirtingai išreiškia mRNR abiejose situacijose. Ši informacija gali nukreipti mokslininkus į gydymo tikslus. Skirtingų tipų ląstelės taip pat gamina skirtingus mRNR modelius, nes kiekvienas ląstelių tipas turi skirtingą darbą.
CDNR mikromatricos pagrindas yra tas, kad bandymas identifikuoja išreikštą mRNR iš mėginio iki jautrumo, leidžiančio eksperimentuotojui išsiaiškinti, kurie genai ekspresuoja daugiau nei kiti, o kurie iš viso neišreiškia. Kadangi cDNR mikromatrica paprastai tikrina šimtus tūkstančių mRNR sekų, tai dažniausiai atliekama mašina. Analitikas tiesiogiai nenaudoja mRNR, kurią išskiria iš ląstelės, o daro tos mRNR kopiją kaip DNR seką.
Komercinės įmonės gamina cDNA mikrogardelių plokštes laboratorijoms naudoti. Jie sukuria DNR sekas, atitinkančias šimtus ar tūkstančius genų, kuriuos eksperimentuotojas nori išbandyti, ir kiekvieną atskirai įdeda į vieną mikromatricos stiklelį. Tai reiškia visus genus, kurie gali būti išreikšti toje grupėje.
Tada laboratorijoje sukuriamos papildomos mRNR sekos, kurias tyrėjas išskiria iš ląstelės, kopijuojant RNR į DNR. Šie produktai turi seką, kuri prilimpa prie DNR ant mikrogardelių stiklelio, iš kurio būtų pagaminta mRNR. Tada analitikas prie šių cDNR sekų pritvirtina fluorescencines molekules.
Uždengus mikrogardelės stiklelį cDNR, visos papildomos sekos gali sulipti. Tada stiklelis nuplaunamas, kad būtų pašalinta nesurišta cDNR. Tada skaitytuvas išmatuoja fluorescencijos kiekį, jei toks yra, kiekviename atskirame DNR taške. Genai, kurie išreiškia daugiau mRNR, turės daugiau fluorescencinės cDNR, nei genai, kurie ekspresuoja mažiau mRNR. Tokiu būdu analitikas gali išsiaiškinti, kurie genai yra aktyvesni už kitus, ir palyginti rezultatus su kitokio tipo ląstelėmis.