Čekių išgryninimas reiškia laiką, per kurį bankas apdoroja mokėjimą popieriniu arba elektroniniu čekiu. Priklausomai nuo finansų įstaigos dydžio, čekių išgryninimo procesas gali skirtis. Galiausiai mokėjimas iš kliento banko sąskaitos atliekamas gavėjui tuo metu, kai apdorojamas čekis.
Tačiau prieš apdorodamas čekį bet kurioje finansų įstaigoje, klientas turi turėti einamąją sąskaitą. Lėšos paimamos iš tos sąskaitos. Jei prašoma pinigų suma viršija sąskaitos dydį, gali būti grąžintas čekis dėl lėšų trūkumo ir iš kliento gali būti taikomi overdrafto mokesčiai. Kai kurie bankai siūlo overdrafto apsaugą, kuri leidžia apmokėti čekius, net jei nėra lėšų. Apsauga nuo overdrafto paprastai apima apribojimus ir mokesčius, susijusius su paslauga.
Didelę pajamų dalį bankai priklauso nuo pajamų, gaunamų iš overdrafto mokesčių. Šie mokesčiai sudaro didžiausią paslaugų mokesčių už indėlių sąskaitas dideliems bankams kasmet dalį. Bankas dar labiau priklauso nuo mokesčių pajamų, kai patiriamas spaudimas pajamoms iš kitų finansinių produktų, pavyzdžiui, hipotekos. Klientai daugiausia problemų su čekių apskaita turi lapkričio, gruodžio ir sausio mėnesiais. Didelė šių mokesčių dalis yra apskaičiuojama šiuo laikotarpiu, nes vartotojai yra linkę išleisti daugiau pinigų atostogų sezono metu.
Kai kuriuose regionuose bankas turi nurodyti metodą, kurio jis taiko čekio kliringumui atlikti. Pavyzdžiui, vienas iš būdų yra apdoroti čekius, kai jie gaunami, neatsižvelgiant į čekio vertę. Kitas būdas, plačiai paplitęs tarp didelių bankų, yra čekių apdorojimas nuo didelio iki žemo lygio. Šiame procese didžiausios vertės patikrinimas apdorojamas prieš bet kurį iš mažesnių patikrinimų.
Jei tą pačią dieną bankas gauna kelis čekius, o bendra čekių suma viršija kliento banko sąskaitoje turimą sumą, tai gali pakenkti sąskaitai. Bankas, kuris naudoja čekių tarpuskaitą nuo didelio iki mažo, pirmiausia apdoros didžiausią čekį, o po to mažėjančia tvarka apdoros mažesnius čekius. Tai padidina tikimybę, kad einamoji sąskaita bus permokėta po pirmojo didelio čekio apdorojimo, todėl apdorojant kiekvieną smulkesnį čekį klientas turės daugiau pereikvojimo mokesčių.
Debeto kortele klientai gali pasiekti kitą čekio išgryninimo formą. Debeto kortelė veikia panašiai kaip čekis, išskyrus tai, kad operacijos paprastai apdorojamos operacijos metu, o tai gali sumažinti overdrafto mokesčius. Atliekant einamosios sąskaitos operaciją, lėšos išrašomos, kai bankas gauna čekį, o tai gali būti praėjus kelioms dienoms po pirkimo.