Cheminiai barjerai, susiję su žmogaus imunologija, yra riebalų rūgštys, baltymai, kūno išskyros ir kitos natūralių savybių turinčios medžiagos, padedančios apsaugoti organizmą nuo ligų ar infekcijų. Tokios medžiagos gali turėti antimikrobinių savybių, žemą pH arba padėti suardyti ar destabilizuoti bakterijų ląsteles. Dauguma šių kliūčių nėra sukurtos kaip pirminė imuninės sistemos apsauga, o turi tokias savybes kaip antrinė funkcija. Nedaugelis egzistuoja tik kaip imuninės sistemos gynybinis mechanizmas.
Žmogaus kūnas turi daugybę sistemų, skirtų apsisaugoti nuo galimų grėsmių ar infekcijų, įskaitant įgimtą ar adaptuotą imunitetą, aktyvius ar pasyvius mechanizmus ir anatominius, humoralinius ar ląstelinius barjerus. Kalbant apie cheminių barjerų skirstymą į kategorijas, tokie mechanizmai yra įgimti, pasyvūs ir priklauso anatominių kliūčių kategorijai.
Tokios kliūtys yra įgimtos imuninės sistemos dalis gimimo metu. Kitaip tariant, organizmas neturi pritaikyti imuninės sistemos kovoti su infekcijomis naudodamas šias kliūtis, nes jos atsiranda prieš pirmąją žmogaus gyvenimo dieną. Cheminių barjerų klasifikavimas kaip pasyvus rodo, kad pagalba imuninei sistemai yra antrinė funkcija. Kaip anatominės kliūtys, jos yra už kūno audinių, o ne ląstelių lygyje.
Baltymai, rūgštys, sekretai ir fermentai, sudarantys cheminius barjerus, gaminami tam, kad būtų galima atlikti konkrečias pagrindines užduotis, kurios yra normalių ar nevalingų kūno funkcijų dalis. Pavyzdžiui, organizmas gamina prakaitą kaip natūralios aušinimo sistemos dalį. Prakaitavimas taip pat yra pasyvus barjeras žmogaus imuninei sistemai, nes jo žemas pH slopina bakterijų augimą.
Kitos apsaugos priemonės yra seilės, ašaros ir nosies išskyros. Šiose medžiagose yra ir lizocimo, ir fosfolipazės – medžiagų, kurios natūraliai ardo bakterijų ląstelių išorinę sienelę ir ląstelių membranas. Pagrindinis seilių tikslas yra padėti virškinimui, kai ašaros ir nosies išskyros padeda nuplauti pašalines medžiagas ir išlaikyti kūno membranas drėgnas. Tai, kad šios cheminės medžiagos taip pat neigiamai veikia grėsmingas bakterijas, yra daugiau šalutinis poveikis nei pagrindinė funkcija.
Vidinės cheminės kliūtys taip pat apsaugo nuo infekcijos, jei bakterijos ar kitos grėsmės patenka į vidines sistemas ar organus. Plaučiuose ir virškinimo trakte esantys baltymai, žinomi kaip defensinai, turi antimikrobinių savybių, kurios naikina tam tikras bakterijų rūšis. Kitos virškinimo trakto cheminės medžiagos konkuruoja su infekcinėmis ląstelėmis dėl maistinių medžiagų arba prisitvirtina prie ląstelių sienelių, badydamos kenksmingas ar grėsmingas ląsteles. Kaip ir prakaite esančios riebalų rūgštys, virškinimo trakto cheminės medžiagos taip pat turi žemą pH, o tai dar labiau slopina kenksmingų bakterijų augimą organizme.