Kas yra DNR gelio elektroforezė?

DNR gelio elektroforezė yra procesas, naudojamas baltymams ir nukleino rūgštims atskirti molekulinėje biologijoje. Gelis paprastai sudarytas iš kryžminio ryšio polimero ir akrilamido, kurie padeda atskirti ir analizuoti skirtingas DNR molekulės dalis. DNR gelio elektroforezė dažniausiai naudojama kriminalistikoje, siekiant nustatyti konkrečią DNR seką, padedančią surasti pagrindinį įtariamąjį. Jis taip pat dažnai naudojamas genetikoje ir molekulinės biologijos bei biochemijos srityse.

Nukleino rūgštys ir baltymai turi teigiamą arba neigiamą krūvį. Įdėjus į elektrinę kamerą DNR gelio elektroforezės metu, kiekvienas elektros krūvis judės link bet kurio kameros galo. Neigiamą elektrinį krūvį turinčios molekulės judės į teigiamą kameros galą, o teigiamos elektriškai įkrautos molekulės – į neigiamą galą. Gelis atskiria kiekvieną iš šių molekulių, todėl jos tolygiai pasiskirsto skaitymo metu. Gelis sudarytas iš ilgų skaidulų, kurios neleidžia molekulėms judėti ir padeda analizuoti atskiras molekules.

Southern blot yra metodas, naudojamas DNR gelio elektroforezėje, siekiant nustatyti konkrečios nukleotidų sekos buvimą ar nebuvimą DNR molekulėje. Northern blot yra kitoks metodas, naudojamas genų ekspresijai nustatyti esant RNR arba ribonukleino rūgščiai. Rytų blotavimas naudojamas lipidų, baltymų ir angliavandenių buvimui DNR sekoje nustatyti. Norint paprasčiausiai aptikti baltymus DNR sekoje, elektroforezės kameroje, izoliuojant gelį, naudojamas Western blot metodas.

Zimografija taip pat yra būdas aptikti tam tikras biologines funkcijas naudojant DNR gelio elektroforezę. Jis daugiausia naudojamas tiriant ekstraląstelinę matricą ardančius fermentus, kurie katalizuoja matricos sunaikinimą už ląstelės ribų, taip pat ląstelės bazinę membraną. Poliakrilamido gelio naudojimas padeda atskirti fermentus, kurie yra baltymai, naudojant baltymų substratą, pvz., želatiną arba kazeiną. Šis metodas naudojamas išmatuoti degradacijos aktyvumą, vykstantį už ląstelės ribų.

DNR gelio elektroforezė kriminalistikoje naudojama gana dažnai. Jis naudojamas kraujo baltymams ir DNR atskirti nusikaltimo vietoje, siekiant nustatyti sąsajas su turimais įtariamaisiais. Gelio elektroforezė taip pat naudojama specifiniam genetikos paveldėjimui nustatyti, nes tam tikra DNR ir baltymai yra susiję su skirtingomis rasėmis. Jis taip pat naudojamas sprendžiant tėvystės bylas, siekiant nustatyti santykinius asmenų santykius.