Kas yra DNR nusodinimas?

Dezoksiribonukleino rūgšties (DNR) nusodinimas yra pagrindinis mokslo genetinės medžiagos išskyrimo ir gryninimo žingsnis. Paprastai biologinio audinio mėginyje yra DNR arba RNR kartu su likusia organizmo kūno dalimi. Kad galėtų ištirti DNR, mokslininkas turi atskirti DNR nuo visų kitų medžiagų. DNR nusodinimas konkrečiai reiškia etapą, apimantį ištirpusios DNR atskyrimą nuo skysčio, kuriame ji yra ištirpinta. Įprasti DNR nusodinimo metodai apima etanolio, izpropanolio arba glikogeno įdėjimą į skystį, dėl kurio DNR sukietėja gabalėliais ir nukrenta į skysčio mėginio apačioje.

Pradiniai DNR iš mėginio valymo veiksmai gali būti tokie paprasti, kaip lapų susmulkinimas dubenyje, kad būtų suardyta dalis struktūros. Tada košė gali būti suskaidyta cheminėmis medžiagomis arba fermentais, kurie palieka nepažeistą DNR. Paprastai genetikai naudoja centrifugą, kad padėtų padalinti skirtingus mėginio komponentus. Tai mašina, kuri sukasi mėginį taip, kad sunkiausias komponentas nugrimztų į apačią, o lengviausias kiltų į viršų.

Pašalinus įvairius nepageidaujamus komponentus, genetikui dažniausiai lieka skaidrus skystis, kuriame yra genetinės medžiagos. Tada jis arba ji turi išimti tame skystyje ištirpusią DNR ir išmesti skystį bei kitas skystyje esančias medžiagas. DNR nusodinimas yra būdas, kuriuo tai pasiekiama. Dažniausiai mokslininkui reikia į skystį įpilti cheminės medžiagos, kuri atlieka DNR nusodinimą.

Etanolis arba izopropanolis, kurie abu yra alkoholio formos ir patenka į cheminių medžiagų tirpiklių grupę, yra dažniausiai naudojamos cheminės medžiagos DNR nusodinimui. Glikogenas yra kita medžiaga, galinti nusodinti DNR, tačiau ji naudojama rečiau, išskyrus mažos koncentracijos genetinės medžiagos nusodinimą. Kai šios cheminės medžiagos susimaišo su ištirpusia DNR, jų chemija leidžia joms pakeisti būdą, kaip DNR telpa į aplinką. Jei anksčiau DNR lengvai maišėsi su skysčiu, po cheminio pridėjimo ji nustoja jungtis su skysčiu ir virsta kieta medžiaga.

Ši kieta medžiaga paprastai yra balkšva ir susikaupia. Kadangi kai kurios kietosios medžiagos vis dar yra mažose dalelėse, mokslininkas paprastai deda mėginį į centrifugą, kad visos kietosios medžiagos susuktų į nuosėdas mėgintuvėlio apačioje. Tai išgryninta DNR, iš pradžių buvusi mėginyje, forma, kuri yra naudinga atliekant tyrimus. Paprastai skystis, kuriame granulės yra suspenduotos, pašalinamas iš vamzdelio, o granulės taip pat gali būti išdžiovintos, kad chemikalai išgaruotų, kad granulės būtų kuo grynesnės.