Ekologiški augalai auginami nenaudojant pesticidų ir kitų naftos pagrindu pagamintų chemikalų, o vietoj to naudojami natūralūs metodai, kuriuos ūkininkai taikė tūkstančius metų. Šie metodai apima sėjomainą, dengiamuosius augalus ir kompostą žemei tręšti bei natūralius metodus, skirtus užkirsti kelią vabzdžiams ir kitiems kenkėjams arba juos atsikratyti. Be to, ekologiški augalai neauginami iš genetiškai pakeistų sėklų. Ūkininkai naudoja ekologiškų augalų auginimo metodus, nes manoma, kad jie yra ekologiškesni ir saugesni valgyti, nes ant jų ar viduje nėra cheminių medžiagų likučių pėdsakų.
Kol pasėliai auginami taikant tam tikrus metodus, jie laikomi ekologiškais augalais. Ekologiškų kultūrų pavadinimus kuria įvairūs vyriausybiniai subjektai, kurie apibrėžia taisykles, kurių reikia laikytis norint įtraukti į šią kategoriją. Tai reiškia, kad gali būti ekologiškų vaisių, daržovių, grūdų, gėlių ir daugybės kitų ekologiškų augalų rūšių.
Didžioji dalis ekologiškų produktų ūkininkavimo yra natūralių metodų naudojimas žemei tręšti. Sėjomaina – tai planinis žemės naudojimas ūkyje, kad kiekviena ūkio dalis turėtų šiek tiek laiko pailsėti ir atsinaujinti, neaugant joje jokių pasėlių. Ūkininkai turi atsižvelgti į augimo įtaką kiekvienam žemės plotui, taip pat savo poreikius užauginti tam tikrą kiekį pasėlių per sezoną. Dengiamieji pasėliai auginami tarp parduodamų pasėlių, vadinamų grynaisiais, arba per sėjomainos ciklus. Šie augalai padeda papildyti dirvą maisto medžiagomis, todėl dengiamieji augalai parenkami atsižvelgiant į dirvožemio poreikius ir augalų galimybes.
Kompostas padeda natūraliai tręšti žemę, naudojant daug maistinių medžiagų turinčias atliekas, kurios ilgainiui virsta dirvožemiu. Tai taip pat padeda natūraliai apsaugoti nuo kenkėjų nuo pasėlių. Kiti natūralių pesticidų metodai apima natūralių cheminių medžiagų naudojimą, sodinimą aplink pasėlius ir natūraliai nuo kenkėjus atbaidančių augalų sodinimą.
Ekologiškų kultūrų auginimas ir valgymas turi daug privalumų, įskaitant žemės tvarumą, padidėjusį maistinių medžiagų kiekį dirvožemyje ir pasėliuose ir mažesnę vandens sistemų taršą. Kadangi dirvožemyje, kuriame auginami ekologiški augalai, yra daugiau maisto medžiagų, tai taip pat reiškia, kad iš augalų vartojamas maistas turi daugiau maistinių medžiagų. Ekologiškose kultūrose paprastai nėra pesticidų ir cheminių medžiagų, kurios gali būti kenksmingos žmonių ir kitų rūšių gyvūnų kūnams.