Fc receptoriai randami imuninės sistemos ląstelėse, vadinamose fagocitais, kurios gali vartoti kenksmingas medžiagas arba antigenus. Kiekvienas Fc receptorius gali prisijungti prie vadinamosios antikūno Fc srities. Antikūnai yra specialūs imuninių ląstelių gaminami baltymai, kurie jungiasi su antigenais, tokiais kaip mikroorganizmai, toksinai ar alerginės medžiagos. Jie gali juos neutralizuoti arba pažymėti, kad imuninė sistema juos sunaikins. Kai imuninės ląstelės Fc receptorius prisijungia prie antikūno ir prie jo prijungto antigeno, tai gali sukelti fagocitozę, kai sunaudojamas antikūnu padengtas antigenas.
Egzistuoja įvairių tipų antikūnai, kurių kiekvienas būdingas kitam antigenui. Tai reiškia, kad taip pat egzistuoja skirtingi Fc receptoriai, kurių kiekvienas gali prisijungti prie antikūno savo Fc srityje. Antikūnai taip pat žinomi kaip imunoglobulinai, sutrumpintai Ig, o IgG tipas dažniausiai randamas kraujyje.
IgG antikūnai yra Y formos baltymų struktūros, sudarytos iš skirtingų regionų. Dvi Y rankos yra žinomos kaip Fab regionai, kur Fab reiškia fragmentą, surišantį antigeną. Fc yra uodegos sritis, o Fc reiškia frakciją, kristalizuojama. Fab sritys prisijungia prie antigenų, o Fc sritis prisijungia prie Fc receptorių ląstelės paviršiuje. Į Fc receptorius panaši molekulė taip pat buvo aptikta imuninėse ląstelėse, vadinamose B limfocitais, tačiau jos funkcija nėra visiškai suprantama ir neatrodo, kad ji prisijungtų prie antikūnų Fc sričių.
Fagocitai, kurie efektyviai valgo kenksmingas daleles, tokias kaip mikrobai, yra grupė, sudaryta iš skirtingų tipų ląstelių, kurių paviršiuose yra IgG surišančių Fc receptorių. Jie apima imuninės sistemos baltuosius kraujo kūnelius, žinomus kaip makrofagai ir neutrofilai. Imuninės sistemos ląstelės, žinomos kaip natūralios žudikės, taip pat yra padengtos Fc receptoriais, kurie jungiasi su IgG. Natūralios žudikų ląstelės gamina veiksnius, kurie sukelia kenksmingų ląstelių, tokių kaip bakterijos, mirtį ir pritraukia kitas imunines ląsteles, kad padėtų jas sunaikinti. Fc receptorius, kuris jungiasi prie kito antikūno, IgE, randamas putliųjų ląstelių paviršiuje, kurios reaguoja į antigenus, pavyzdžiui, žiedadulkes, išskirdamos uždegimą sukeliančias medžiagas.
Kartais vyksta procesas, žinomas kaip nuo antikūnų priklausomas stiprinimas, kai Fc receptoriaus buvimas padeda virusui patekti į ląstelę. Ląstelėje nėra jokių receptorių, reikalingų virusui patekti, bet kai virusas yra prijungtas prie antikūno, jis gali prisijungti prie Fc receptoriaus per antikūno Fc sritį. Šis padidėjęs gebėjimas patekti į ląsteles padidina infekcijos atsiradimą.