Hipokampo sklerozė yra sutrikimas, kai nervinės ląstelės miršta ir smegenų srityje, vadinamoje hipokampu, susidaro randų audinys. Yra žinoma, kad ši būklė yra susijusi su maždaug trimis ketvirtadaliais smilkininės skilties epilepsijos atvejų – liga, kai žmonės patiria neįprastus pojūčius, pakitusias emocijas ir elgesį, raumenų spazmus ir kartais traukulius. Nepaisant šio tvirto ryšio, nėra žinoma, ar hipokampo sklerozė sukelia smilkininės skilties epilepsiją, ar smilkininės skilties epilepsija sukelia hipokampo sklerozę. Gali būti, kad abi sąlygos yra susijusios su kita esmine anomalija.
Hipokampas yra smegenų srityje, vadinamoje medialine smilkinine skiltimi, kur jis yra vadinamosios limbinės sistemos dalis. Būdamas limbinės sistemos, kuri yra susijusi su uoslės pojūčiu, baimės pojūčiu ir ilgalaikės atminties formavimu, dalis, hipokampas dalyvauja formuojant naujus prisiminimus. Taip pat manoma, kad ji atlieka vadinamąją erdvinę navigaciją – procesą, kuris priklauso nuo to, ar asmenys sugeba atsiminti ir palyginti savo esamą ir ankstesnę padėtį aplinkoje, kad galėtų orientuotis. Nors šios smegenų srities sklerozė dažniausiai yra susijusi su smilkininės skilties epilepsija, dažnai taip pat dalyvauja kitos limbinės sistemos struktūros, pavyzdžiui, migdolinis kūnas, kuris kontroliuoja baimės jausmą.
Naudojant magnetinio rezonanso tomografijos (MRT) skenavimą, pagrindinis hipokampo pokytis, kai jį paveikė hipokampo sklerozė, yra jo dydžio sumažėjimas. Apžiūrint hipokampo pavyzdžius pro mikroskopą, galima pastebėti, kad atskiros nervinės ląstelės buvo prarastos ir atsirado randai. Manoma, kad šią žalą gali sukelti per didelis kai kurių neurotransmiterių – cheminių medžiagų, kurios perduoda signalus tarp nervų – išsiskyrimas. Šie konkretūs neurotransmiteriai jungiasi prie specialių nervinių ląstelių receptorių, todėl kalcio patenka į vidų; perteklius, kalcio perteklius sukelia ląstelių mirtį.
Mokslininkai ištyrė, ar epilepsijos priepuoliai gali sukelti hipokampo sklerozę. Buvo manoma, kad vaikystėje atsirandantys priepuoliai, pvz., susiję su karščiavimu, gali sužaloti smegenis, pažeisti hipokampą ir vėlesniame amžiuje sukelti smilkininės skilties epilepsiją. Nors kai kuriems vaikams, patyrusiems tokius priepuolius, vėliau nustatoma hipokampo sklerozė, dauguma jų neturi, todėl negalima žinoti, ar sklerozė išsivystė prieš pirmąjį priepuolį. Kita teorija teigia, kad smilkininės skilties defektai gali sukelti polinkį į hipokampo sklerozę ir traukulius. Arba paveldimų, aplinkos ir vystymosi veiksnių derinys gali padidinti kai kurių žmonių polinkį į epilepsiją ir hipokampo sklerozę.