Idiotipas yra aminorūgščių, kurios yra unikalios antikūnui ir kurios lemia jo specifiškumą, kitaip tariant, su kokiais antigenais jis prisijungs, rinkinys. Idiotipų tyrimas yra svarbus imunologams, kurie turi suprasti, kaip organizmas gamina ir naudoja antikūnus. Vakcinos gamyboje galima panaudoti idiotipus, kad pacientas pradėtų gaminti tinkamus antikūnus ir apsaugotų nuo tam tikrų antigenų. Laboratorinėje aplinkoje galima nustatyti šių aminorūgščių seką.
Šios struktūros dažnai yra antigeno surišimo vietoje arba šalia jos, antikūno dalyje, žinomoje kaip komplementarumą lemianti sritis (CDR) arba hiperkintamoji sritis. Vienas antikūnas gali turėti kelis idiotipus. Idiotipas yra labai specifinis – tiek, kad žmonės kartais gali reaguoti į savo idiotipus ir tikrai reaguos į tuos, kuriuos atneša kiti žmonės ar rūšys. Kai tai daroma sąmoningai su vakcina, tai gali paskatinti imuninę sistemą gaminti antikūnus, kurie atsispirtų infekcinėms ligoms.
Tai vienas iš antikūnų klasifikavimo būdų. Šiek tiek platesniu lygmeniu antikūnai gali būti klasifikuojami pagal allotipus, genetines antikūnų struktūros variacijas, kurios gali atspindėti genetinį paveldą. Glaudžiai giminingi žmonės linkę turėti panašius allotipus, tačiau gali reaguoti į alotipus, susidarančius nesusijusių žmonių kūnuose. Tai gali būti problema dėl procedūrų, tokių kaip kraujo perpylimas, kai antikūnų atitikimas yra labai svarbus siekiant išvengti nepageidaujamų reakcijų.
Dar plačiau, antikūnai gali būti klasifikuojami pagal izotipą, būdingą visiems tos pačios rūšies atstovams. Pavyzdžiui, imunoglobulinas M yra žmogaus izotipas, baltymas, kurio randama kiekviename žmoguje, išskyrus tuos, kurie turi genetinį sutrikimą, dėl kurio susilpnėja imuninė funkcija. Laipsniška antikūnų klasifikacija gali padėti tyrėjams tiriant antikūnus ir jų funkcijas.
Idiotipas yra labai unikalus; tik identiško specifiškumo antikūnai turės tą patį idiotipą, tačiau antikūnai, kurių specifiškumas skiriasi, gali turėti tuos pačius izotipus ir allotipus. Tyrėjai gali naudoti laboratorinius tyrimus, kad nustatytų tam tikrus mėginio idiotipus ir suskirstytų juos, kad sužinotų daugiau apie tai, kaip jie veikia. Galima naudoti laboratorinius gyvūnus tam tikro specifiškumo žmogaus idiotipams gaminti, kad būtų galima naudoti tyrimams ir naujų vakcinų kūrimui. Idiotipo variacijos taip pat gali paaiškinti, kodėl žmonės gali turėti antikūnų prieš vieną ligos padermę, bet ne prieš kitus, nes jie negali prisirišti prie antigenų, su kuriais jie nėra skirti susieti, kaip matyti gripo atvejais.