Jutos valstijos vėliavos istorija prasideda 1903 m., kai gubernatorius pavedė Jutos valstijos Amerikos revoliucijos dukterų skyriui (USDR) sukurti vėliavą, kurią jis galėtų nuvežti į 1904 m. Sent Luiso pasaulinę parodą. Atitinkamai USDR sukūrė vėliavą, kurią sudarė Jutos valstijos antspaudas, išsiuvinėtas mėlyname fone. Kiekvienas narys įnešė po vieną dolerį už vėliavos statybą, o skyriaus narys išsiuvinėjo dizainą ant Jutos šilko. Dėl įvairių teisinių klaidų ir projektavimo klaidų įstatymų leidėjas Jutos valstijos vėliavą patvirtino tik 1911 m. Nuo tada reikėjo atlikti kai kuriuos papildomus teisės aktų pakeitimus dėl susiuvimo klaidų, padarytų gamybos procese 1913 ir 1922 m.
Vėliau, 1903 m., USDR išsiaiškino, kad buvo padaryta klaida piešiant ir išsiuvinėjant valstybės antspaudą ant vėliavos. Tuo pačiu metu gubernatorius ir USDR atkreipė dėmesį į tai, kad norint, kad vėliava būtų laikoma Jutos valstijos vėliava, projektavimui ir konstrukcijai reikia įstatymų leidėjo patvirtinimo, o ne tik gubernatoriaus pritarimo. Dėl šios priežasties tai, kas buvo laikoma Jutos valstijos vėliava, galėjo būti laikoma tik gubernatoriaus pulko vėliava. Juta ką tik buvo priimta į Sąjungą 1896 m., o tai padėjo sukelti painiavą dėl proceso. Vietinis menininkas ištaisė klaidą valstybės antspaudo piešinyje, ir įstatymų leidėjas galiausiai vėliavą pripažino Jutos valstijos vėliava.
1912 m. kita organizacija, Sons and Daughters of Utah Pioneers, paprašė rytų firmos pagaminti naujos vėliavos kopiją, kurią nariai galėtų pateikti mūšio laivui USS Utah. Vėliava atkeliavo su klaidomis: bendrovė dalį antspaudo nuspalvino ir aplink ją uždėjo auksinį apskritimą, todėl ji nebebuvo įstatymų leidėjo patvirtinta vėliava. Užuot grąžinusi vėliavą, organizacija įtikino įstatymų leidėją priimti įstatymo projektą, leidžiantį vėliavos dizaino pakeitimus tapti oficialios valstybės vėliavos dalimi. Šią netyčia pertvarkytą vėliavą įstatymų leidėjas priėmė kaip valstybės vėliavą 1913 m.
Tada 1922 m. kitas gamintojas padarė klaidą ir datą įdėjo neteisingoje vėliavos vietoje. Kiekviena vėliava nuo 1922 m. buvo padaryta su ta klaida. 2011 m. buvo priimtas teisės aktas, reikalaujantis, kad vėliavų gamintojai ištaisytų šią klaidą kiekvienoje Jutos valstijos vėliavoje.