Kaukolė yra viršutinė kaukolės struktūra, įskaitant viską, išskyrus apatinį žandikaulį arba žandikaulį. Kaukolė apsaugo smegenis ir galvą bei palaiko tokias veido struktūras kaip akis ir ausis, laikydamas jas tinkamoje vietoje, kad sensorinė informacija būtų gauta efektyviausiai. Gyvūnai, turintys kaukolę, bendrai vadinami kraniatais.
Kaukolė yra ne vienas kaulas, o daug. Jie sujungiami siūlėmis, o ne jungtimis, kurios leidžia labai mažai judėti. Žmogaus kaukolė susideda iš 21 kaulo ir yra suskirstyta į neurocranium arba smegenų korpusą, kuris supa ir apsaugo smegenis, ir splanchnocranium, kuris palaiko veido struktūras.
Neuokranio kaulai yra priekinis kaulas, pakaušio kaulas, spenoidinis kaulas, etmoidinis kaulas, du parietaliniai kaulai ir du smilkininiai kaulai. Be apatinio žandikaulio, splanchnocranium apima du viršutinius žandikaulius, du gomurinius kaulus, du žandikaulio kaulai, du nosies kaulai, du ašarų kaulai, dvi apatines nosies kriaukles ir vomerinį kaulą. Kaukolėje taip pat yra paranaliniai sinusai, kurie yra oro užpildyti kanalai, susisiekiantys su nosies kanalais šnervių viduje.
Amniotai, gyvūnų grupė, įskaitant žinduolius, paukščius ir roplius, gali būti klasifikuojami pagal kaukolės tipą. Kai kuriuose vaisiaus vandenyse kaukolės smilkininiame kaule yra dvišalės simetriškos skylės, vadinamos laikinosiomis fenestrae. Gyvūnai, neturintys laikinų fenestrų, priskiriami anapsidėms. Vėžliai yra vienintelės gyvos anapsidės.
Sinapsidės turi po vieną mažą žemą angą kiekvienoje kaukolės pusėje už akies, o diapsidės turi dvi angas kiekvienoje pusėje. Abi grupės yra labai įvairios. Euriapsidės, kurios dabar yra išnykusios, turėjo aukštą angą abiejose kaukolės pusėse už akies. Jie išsivystė iš diapsidžių, bet prarado apatinę angą. Žinduoliai laikomi sinapsidėmis, nors jie išsivystė taip, kad nebeturi laikinų fenestrų.
Žuvų kaukolės yra mažiau išsivysčiusios nei amniono. Dauguma žuvų kaukolių turi sumažintą struktūrą ir daugiausia susideda iš kremzlės, o ne iš kaulų. Žiediniai unguriai turi paprasčiausią kaukolę iš visų gyvų kaukolių, susidedančią tik iš laisvos kremzlinių skaidulų struktūros, kuri nevisiškai apgaubia smegenis. Raypelekinės žuvys arba aktinopterygii turi geriau susiformavusią ir kaulesnę kaukolę nei kitų rūšių žuvys.