Medicinoje ligos patogenezė yra terminas, apibūdinantis ligos kilmę ir vystymąsi. Ligos patogenezės tyrimas, kuris dažniau vadinamas tiesiog patogeneze, sudaro platesnių patobiologijos ir patologijos sričių pošakį. Nors patobiologija ir patologija nurodo bendrą ligos biologiją, vystymąsi ir progresą, patogenezė paprastai sutelkia dėmesį į veiksnius, lemiančius pradinę ligos kilmę.
Daugelio ligų atveju ligos patogenezę veikia keli veiksniai. Pavyzdžiui, asmuo gali turėti genetinį polinkį į ligą, tačiau liga iš tikrųjų gali nepasireikšti, nebent taip pat yra tam tikrų aplinkos veiksnių. Panašiai su tam tikromis infekcinėmis ligomis užsikrėtęs asmuo dažnai kovoja be jokių simptomų. Tokios infekcijos gali sukelti ligą, pavyzdžiui, tik tuo atveju, jei yra ją sukeliančių bakterijų ar virusų, o tuo pačiu metu susilpnėja užsikrėtusio asmens imunitetas dėl netinkamos mitybos ar imuninės sistemos sutrikimo.
Yra daug įvairių ligų patogenezės tipų. Tai apima virusų ar bakterijų invaziją į organizmą, uždegimą kaip atsaką į chemines medžiagas, fizines traumas, vėžinių ląstelių buvimą ir daugybę skirtingų genetinių sutrikimų. Kadangi yra tiek daug galimų ligų šaltinių, gydytojai ir mokslininkai, tiriantys ligų patogenezę, dažnai specializuojasi vienoje konkrečioje patogenezės srityje.
Kai kurios specializuotos patogenezės sritys apima hematopatologiją, klinikinę mikrobiologiją, genetiką ir imunopatologiją. Hematopatologija yra susijusi su kraujo, kaulų čiulpų ir limfinės sistemos sutrikimais ir tuo, kaip tokie sutrikimai gali sukelti ligą. Klinikinėje mikrobiologijoje patogenezės tyrimas apima bakterijų ir virusų plitimo ir dauginimosi tyrimą. Genetika turi labai didelę įtaką patogenezei, nes daugelis ligų iš dalies arba visiškai atsiranda dėl konkretaus geno, mutacijos ar paciento genetinės medžiagos anomalijos. Imunopatologija yra ypač svarbi infekcinių ligų patogenezei, nes ji susijusi su imunine sistema, įskaitant tai, kaip imuniteto silpnumas gali leisti virusui ar bakterijai įsitvirtinti ir sukelti ligą.
Kai kurie gydytojai specializuojasi vienoje iš pirmiau minėtų patogenezės sričių, kiti gydytojai ir mokslininkai gali dirbti keliose srityse. Taip dažnai atsitinka asmenims, kurie tiria patogenezę, nes ji susijusi su konkrečia liga. Kai kurių vėžio atvejų supratimas apie visą ligos patogenezę gali apimti genetinius, infekcinius, cheminius ir imunologinius veiksnius.