LOD balas yra dviejų genetinių bruožų ryšio tikimybės atvaizdas. Jei balas aukštas, tai reiškia, kad bruožai yra glaudžiai susiję, todėl dažniausiai paveldimi kartu. Kita vertus, žemi balai rodo žemą ryšį. Suprasti šiuos skaičius genetikams svarbu dėl daugelio priežasčių: nuo noro suprasti tam tikras genetines sąlygas iki noro išsiaiškinti, kur yra genas, naudojant informaciją apie žinomus genus.
Norint suprasti LOD balo svarbą, naudinga žinoti, kad kuo arčiau vienas kito yra du genų lokusai, tuo didesnė tikimybė, kad jie bus paveldimi kartu. Pavyzdžiui, jei genai yra skirtingose chromosomose, jie dažniausiai paveldimi atskirai, nes mejozės metu gali įvykti daug kryžminimosi. Genai, esantys toje pačioje chromosomoje, bet toli vienas nuo kito, taip pat dažniausiai paveldimi nepriklausomai. Tačiau kai lokusai yra arti toje pačioje chromosomoje, jie linkę būti paveldimi kartu. Ši informacija yra balų sistemos pagrindas.
LOD reiškia „šansų logaritmą“, atspindintį faktą, kad skaičius išreiškiamas logaritmiškai. Paprastai, jei rezultatas yra 3 ar didesnis, tai reiškia, kad yra didelė genetinio ryšio tikimybė. Mažesni skaičiai rodo mažesnę genetinio ryšio tikimybę, nors jie vis tiek gali būti naudingi pašalinimo procese.
Norint nustatyti LOD balą, reikia duomenų imties, o atliekant tokio tipo statistinę analizę, kuo didesnė imtis, tuo geriau. Tyrėjai, dirbantys su tokiais organizmais kaip vaisinės musės, gali aktyviai veisti populiaciją, kad atskleistų arba nuslopintų norimus bruožus, kad ištirtų ryšį tarp konkrečių bruožų, o su populiacijomis, tokiomis kaip žmonės, tyrėjai turi apsiriboti stebėjimo būdu surinktais duomenimis. Didelės imtys paprastai duoda statistiškai reikšmingesnės informacijos, nes sumažina klasterių ir grupių, kurios iškreipia duomenis, riziką.
Naudodami duomenis iš dominančios populiacijos, mokslininkai tiria, kaip dažnai tam tikri bruožai atsiranda kartu ir kaip dažnai jie atsiranda atskirai. Ši informacija naudojama norint nustatyti rekombinacijos dažnį, žiūrint, kaip dažnai rekombinuojasi genetiniai bruožai. Norint būti toje pačioje chromosomoje, rekombinacijos dažnis turi būti mažesnis nei 50%, o jis turi dar labiau sumažėti, kad parodytų, jog lokusai yra arti vienas kito. Tyrėjai analizuoja šią informaciją, kad nustatytų, kokia tikimybė, kad yra genetinis ryšys, ar ne. LOD balas nustatomas padalijus ryšio tikimybę iš ryšio nebuvimo tikimybės. Paprastai balai skaičiuojami keliems lokusams.