Medicinos mikrobiologija yra mikrobiologijos šaka, kurioje pagrindinis dėmesys skiriamas medicinos interesų mikroorganizmams. Medicinos mikrobiologai tiria organizmus, galinčius sukelti žmonių ligas, nagrinėdami tokių organizmų gyvavimo ciklą, kaip jie sukelia žmonių infekcijas, kaip jie plinta, ką daro žmogaus organizmui ir kaip juos galima išnaikinti. Šios srities žmonės gali dirbti mokslinių tyrimų laboratorijose, tiriančiose mikroorganizmus, arba gali dirbti diagnostikos laboratorijose, atlikti tyrimus, siekiant nustatyti ligas sukeliančius organizmus pacientams ir teikti gydymo rekomendacijas.
Bakterijos, grybai, pirmuonys ir virusai gali sukelti žmonių ligas. Žmones nuo seniausių laikų kolonizavo mikroorganizmai, o mikroorganizmai nuolat vystosi ir keičiasi, kad sutrukdytų žmonių bandymams juos suvaldyti. Medicinos mikrobiologijos sritis užsiima naujų mikroorganizmų identifikavimu, greitai mutuojančių rūšių pokyčių stebėjimu ir nuolatinių mikrobiologijos iššūkių sprendimu – nuo bakterijų atsparumo antibiotikams išsivystymo iki vandens atsargų užteršimo pirmuoniais.
Kaip ir kiti mikrobiologijos tyrinėtojai, medicinos mikrobiologai yra suinteresuoti identifikuoti ir suskirstyti į kategorijas, kuriuos mato. Ši informacija gali padėti žmonėms suprasti, su kuo jie susiduria, ir gali padėti plėtoti gydymą. Organizmų santykių supratimas taip pat gali būti svarbus, kai mokslininkai tiria perdavimo būdus. Identifikavimo procesas taip pat gali apimti organizmo kilmės ir istorijos tyrimus; Pavyzdžiui, sužinoti, kur išsivystė gripo virusas, gali būti svarbu suprasti, kaip kilo epidemija.
Medicininės mikrobiologijos sritis ne tik domisi pačiais mikroorganizmais, bet ir yra susijusi su imunologija, nagrinėja žmogaus apsaugą nuo tokių organizmų ir kaip juos pagerinti ar sustiprinti. Mokslininkai taip pat tiria patologiją, ligos eigą organizme ir epidemiologiją – mokslą, susijusį su tuo, kaip ir kodėl plinta ligos. Medicinos mikrobiologai turi įgūdžių, kuriuos galima pritaikyti kylantiems ligų protrūkiams, nuolatinėms su mikroorganizmais susijusioms problemoms ir daugeliui kitų medicininių iššūkių.
Mokydami medicinos mokykloje daugelis gydytojų tam tikrą laiką praleidžia studijuodami medicinos mikrobiologiją, o kai kurie gydytojai skiria daugiau laiko studijuodami šį dalyką nei kiti. Gydytojams svarbu suprasti, kaip veikia mikroorganizmai, nes šias žinias galima pritaikyti diagnozuojant ir gydant infekcijas. Kai kurie gydytojai gali toliau sutelkti dėmesį į medicininės mikrobiologijos tyrimų pabaigą, kurti naujus kovos su mikroorganizmais metodus ir atlikti klinikinius tyrimus, kad surinktų informaciją apie naujus vaistus, siūlomų gydymo protokolų veiksmingumą ir kitus klausimus.