DNR mikrogardelių analizė naudojama molekulinėje biologijoje ir diagnostinėje medicinoje, siekiant nustatyti, kurie genai ląstelėje yra įjungti tam tikru momentu. Šis metodas žinomas kaip multipleksinis tyrimas, nes vienu tyrimu galima išmatuoti tūkstančius mėginių. DNR mikroanalizės metodai naudojami RNR ir DNR tyrimų duomenims interpretuoti, atsižvelgiant į konkrečius eksperimento reikalavimus.
DNR mikrogardelių analizės pagrindas yra didelis DNR molekulių specifiškumas ir galimybė pasirinkti unikalias DNR sekas, kurios reprezentuotų tam tikrą geną. Mikro matricos analizės eksperimentas atliekamas ant kieto paviršiaus, pagaminto iš stiklo arba silikono drožlių, ant kurio uždedama cheminė matrica. Ant matricos paviršiaus DNR arba RNR zondai yra išdėstyti tvarkingomis eilėmis.
Kai lustas yra nustatytas su reikiamais zondais, tiriamos ląstelės yra paruošiamos. Norint paruošti ląsteles, jas reikia sulaužyti, kad būtų galima išskirti jose esančias nukleorūgštis. Pridedama keletas reagentų, kad ekstrahuotų ir koncentruotų ląstelėse esančias nukleino rūgštis. Tada į lustą pridedamas nukleino rūgšties ekstraktas, kuris paliekamas kelioms valandoms, kad zondai galėtų sąveikauti ir prisijungti prie ląstelių nukleino rūgščių. Galiausiai į lustą pridedama dar viena reagentų serija, siekiant nustatyti vietas, kuriose ląstelių nukleorūgštys susijungė su zondais.
Tada naudojama mikrogardelių analizė, siekiant nustatyti, kurie zondai sugebėjo aptikti ląstelių nukleino rūgštis. Tai dažnai yra sudėtinga analizė, nes vienoje lustoje gali būti dešimtys tūkstančių unikalių zondų. Mikroschemos zondų eilės tvarka saugoma kompiuterinėje duomenų bazėje, kad būtų galima lengvai gauti rezultatus. Naudodamas lustą ir duomenų bazę, mokslininkas gali sudaryti genų, kurie prisijungė prie zondų ir todėl buvo pirminiame ląstelių ekstrakte, sąrašą.
Mikro matricos analizės metodas dažniausiai naudojamas genų ekspresijos profiliavimui. Šio tipo eksperimentuose mikro matrica yra sukurta siekiant ištirti genų ekspresijos modelius ląstelėse. Dominančių genų zondai yra įtraukti į mikromasyvą, o kai eksperimentas baigtas, mikromatricos duomenų analizė gali nustatyti, kurie iš tiriamų genų buvo įjungti tam tikru metu.
Kiti šios technikos naudojimo būdai yra lyginamoji genomo hibridizacija ir SNP aptikimas. Lyginamoji genomo hibridizacija yra testas, kuriuo tiriamas genomo kiekis giminingų organizmų ląstelėse. Šio tipo tyrimai suteikia informacijos apie genetinius ryšius tarp skirtingų rūšių.
SNP aptikimas yra metodas, kurį galima naudoti atliekant teismo ekspertizę, genetinių ryšių analizę ir genetinių ligų rizikos vertinimą. SNP yra vieno nukleotido polimorfizmai, genomo vietos, kuriose yra dvi galimos bazinių porų sekos. SNP gali suteikti daug naudingos genetinės informacijos dėl to, kad skirtingose etninėse ir geografinėse populiacijose egzistuoja skirtingi SNP variantai.