Mikroskopo kondensatorius yra pagrindinė mikroskopo dalis. Jis sufokusuoja šviesą, kuri praeina per mikroskopo pakopą, kurioje yra sumontuotas mėginys, užtikrindamas apšvietimą, kontrastą ir aiškumą. Yra daugybė skirtingų tipų kondensatorių, skirtų naudoti įvairiose srityse ir skirtingos kokybės. Norint įvaldyti mikroskopiją, labai svarbu išmokti tinkamai sureguliuoti kondensatorių, nes prastai naudojamas kondensatorius gali turėti rimtos įtakos vaizdo kokybei ir aiškumui.
Kondensatorius susideda iš objektyvo arba objektyvų rinkinio, sumontuoto tiesiai po scena. Šviesos intensyvumą galima reguliuoti perkeliant mikroskopo kondensatorių arčiau ar toliau nuo scenos, o spindulio plotį galima reguliuoti didinant arba sumažinant diafragmą. Idealiu atveju kondensatorius turėtų būti nustatytas ant plačios angos ir būtų kuo arčiau scenos. Tai suteikia geriausią fokusavimą ir aiškumą.
Vienas iš labiausiai paplitusių mikroskopo kondensatorių tipų yra Abbe kondensatorius, kurį galima rasti daugumoje nebrangių mikroskopų. Taip pat yra sudėtingesnių kondensatorių, taip pat specialių kondensatorių, skirtų tokiai veiklai kaip tamsaus lauko mikroskopija. Kai kuriuose mikroskopuose yra nuimami kondensatoriai, todėl vartotojai gali naudoti skirtingus tipus, o kitais atvejais kondensatorius gali būti pritvirtintas.
Svarbu, kad mikroskopo kondensatorius veiktų gerai ir kad jo nepažeistų dulkės, cheminės medžiagos ir kiti teršalai. Idealiu atveju mikroskopas turėtų būti uždengtas, kai jis nenaudojamas, kad būtų apsaugotas kondensatorius ir kitos dalys, o mikroskopą taip pat gali tekti periodiškai nuvalyti dulkes arba nuvalyti šepečiu, kad pašalintumėte nešvarumus. Taip pat yra specialių alyvų, skirtų judančioms mikroskopų dalims apdoroti, kad mikroskopai judėtų sklandžiai ir patikimai. Daug naudojamų mikroskopų priežiūros įmonės gali sugadinti mikroskopą, kad galėtų išvalyti ir prižiūrėti jo komponentus.
Mikroskopo kondensatoriaus nustatymus galima reguliuoti naudojant ant mikroskopo korpuso pritvirtintas rankenėles. Paprastai, kai pasiekiamas optimalus nustatymas, jį koreguoti reikės tik retai. Tikslus fokusavimo derinimas atliekamas koreguojant okuliarą, tačiau okuliaras taip gerai veiks tik tada, kai kondensatorius nėra tinkamai išdėstytas. Žmonėms, kurie nėra susipažinę su mikroskopo reguliavimo niuansais, gali padėti paprašyti trumpos pamokos iš asmens, turinčio mikroskopijos patirties, pavyzdžiui, gamtos mokslų mokytojo ar parduotuvės, kuri specializuojasi mikroskopų ir mikroskopijos gaminių, darbuotojo.