Misūrio valstijos vėliavą sukūrė Marie Elizabeth Oliver, kuri buvo senatoriaus Roberto Buretto Oliverio žmona. Daugeliu atvejų idėja sukurti Misūrio valstijos vėliavą priskiriama komitetui, kurį 1908 m. sukūrė Amerikos revoliucijos dukterys. Beveik 92 metus Misūris egzistavo kaip inkorporuota valstybė be valstybės vėliavos. Nors baigtas Oliverio valstybės vėliavos dizainas egzistavo jau 1909 m., oficialia valstybės vėliava jis tapo tik 22 m. kovo 1913 d.
Nors Oliverio vėliava tuo metu buvo mėgstamiausia, buvo alternatyvi Misūrio valstijos vėliava, kurią rimtai svarstė Senatas. Šią vėliavą sukūrė Dr. GH Holcomb. Neaišku, ar vėliavos idėja buvo labai populiari tarp Misūrio gyventojų, tačiau dokumentuota, kad priimti įstatymo projektą, kuriuo buvo paskirta oficiali Misūrio valstijos vėliava, teko kelis kartus bandyti. 1913 m. gubernatorius Eliotas Majoras pagaliau pasirašė įstatymo projektą ir vėliava tapo oficialia.
Norint suprasti, kodėl Oliverio pasiūlymas dėl Misūrio valstijos vėliavos buvo sėkmingas, svarbu atsižvelgti į norimas valstybės vėliavos savybes. Dauguma šiame projekte dalyvavusių žmonių manė, kad Holcombo pasiūlytas alternatyvus dizainas nepakankamai atspindi valstybės nepriklausomybę dėl vėliavos panašumo į tautą. Oliverio vėliava buvo simboliškai turtinga, įskaitant daugybę galingų vaizdų, tačiau nebuvo pernelyg sudėtinga atkurti. Tie vaizdai, įskaitant žvaigždes, šalmą ir lokius, buvo specialiai parinkti siekiant atspindėti idėjas ir faktus apie Misūrį, kurie tuo metu buvo laikomi labai aktualiais. Nors bėgant metams Misūrio charakteris keitėsi, pati vėliava yra istorinis įrašas apie tai, kaip žmonės pamatė Misūrį 1913 m.
Misūrio valstijos vėliavos istorija nesibaigia 1913 m., o tęsiasi iki šių dienų. Daug metų Oliverų šeima išlaikė originalią senatoriaus žmonos siūtą vėliavą, tačiau 1961 metais vėliava buvo padovanota valstybei. Jis buvo eksponuojamas daugelį metų, kol dėl amžiaus sugadinus prireikė jį saugoti, kad būtų išsaugotas.
1988 m. 75-osios vėliavos sukūrimo metinės paskatino vėl domėtis originaliu objektu. Norėdami paminėti šį įvykį, Misūrio pradinių klasių mokiniai rinko pinigus, kad vėliava būtų atkurta ir vėl eksponuojama. Taikant šiuolaikinius archyvavimo metodus ir atsidavus Misūrio istorijos išsaugojimui, vėliava tikriausiai daugelį metų bus eksponuojama James C. Kirkpatrick valstijos informacijos centre Džefersono mieste, Misūrio valstijoje.