Natūrali kenkėjų kontrolė apima kenkėjų kontrolės metodus ir sprendimus nenaudojant potencialiai toksiškų medžiagų. Yra daug kenkėjų kontrolės metodų, kurie patenka į šią antraštę, tačiau natūrali kenkėjų kontrolė dažnai apima organinių medžiagų naudojimą kenkėjams kontroliuoti. Kartais maisto produktai, kuriuos žmonės valgo ar gamina, taip pat naudojami kenkėjų kontrolei. Natūrali kenkėjų kontrolė gali apimti tam tikrų augalų naudojimą, siekiant atgrasyti nuo kenkėjų populiacijų. Kai kuriais atvejais tai netgi gali apimti vienos rūšies vabzdžių naudojimą kitų populiacijų kontrolei.
Taikant natūralią kenkėjų kontrolę, siekiama sumažinti ir kontroliuoti kenkėjų populiacijas nedarant žalos aplinkai. Pavyzdžiui, kai kurie žmonės gali naudoti česnakų aliejų arba raudonųjų pipirų purškiklį, kad padėtų kontroliuoti kenkėjus. Mažai tikėtina, kad šie tirpalai sukels ligas ar užterš vandenį, kai prasiskverbia į žemę, kaip tai daro cheminiai pesticidai.
Kai kurie žmonės netgi naudoja maistą, kad natūraliai apsaugotų nuo kenkėjų. Pavyzdžiui, kai kurie sodininkystės ekspertai teigia, kad agurkų pjaustymas ir griežinėlių įdėjimas į savo sodą gali padėti apsaugoti nuo kenkėjų. Rapsų aliejus netgi gali būti naudingas kovojant su kai kurių rūšių sodo kenkėjais.
Asmuo taip pat gali naudoti vabzdžius, kad padėtų kontroliuoti kenkėjus savo sode. Pavyzdžiui, jei jis turi problemų dėl tam tikros rūšies kenkėjų, jis gali sužinoti, kurie naudingi vabzdžiai ėda kenkėją jo sode. Jei vargu ar šie plėšrūnai pakenks jo sodui ar patys taps kenkėjais, jis gali nuspręsti jais apgyvendinti savo sodą. Laikui bėgant šie vabzdžių plėšrūnai gali padėti išlaikyti žemą sodo kenkėjų populiaciją.
Kartais augalai naudojami ir natūraliai kovai su kenkėjais. Pavyzdžiui, medetkos gali padėti atbaidyti kenkėjus iš žmogaus sodo. Tiesą sakant, kai kurie žmonės gamina tirpalą iš susmulkintų medetkų ir naudoja jį kenkėjams atbaidyti savo soduose. Be to, medetkos padeda į sodą pritraukti naudingų vabzdžių. Pavyzdžiui, medetkos traukia raištelius ir parazitines vapsvas.
Taip pat yra keletas natūralių kenkėjų kontrolės medžiagų, kurias galima naudoti patalpose. Diatomitinė žemė, kuri yra milteliai, pagaminti iš gėlo vandens būtybių fosilijų, yra vienas dažniausiai naudojamo natūralaus kenkėjų kontrolės produkto pavyzdžių. Milteliai yra abrazyvūs ir pažeidžia su jais besiliečiančių vabzdžių egzoskeletą. Kai ši kūno danga yra pažeista, vabzdžių kūnas išsausėja ir vabzdys miršta. Šį natūralų produktą galima naudoti ten, kur gali šliaužioti vabzdžiai, taip pat jų slėptuvėse.