Moterys, išgyvenančios menopauzę, gyvenimo periodą, kai baigiasi menstruacinis ciklas, gamina daug mažiau reprodukcinio hormono estrogeno nei vaisinguoju laikotarpiu. Kadangi estrogenų ir kitų reprodukcinių hormonų kiekio sumažėjimas sukelia pokyčius organizme, kai kurios moterys nusprendžia vartoti estrogenų papildus, kad palengvintų su menopauze susijusius simptomus. Deja, tradiciniai estrogenų papildai yra sintetiniai, laboratorijoje apdoroti iš žmogaus organizmui svetimų medžiagų ir yra susiję su daugybe pavojingų šalutinių poveikių, ypač krūties vėžiu. Natūrali estrogenų pakaitinė terapija yra naujesnis pasirinkimas, kurį daugelis moterų ir gydytojų laiko saugesniu ir švelnesniu kūnui. Svarbu pažymėti, kad menopauzė yra natūralus gyvenimo etapas, o ne liga, ir ne kiekvienai moteriai menopauzės metu reikalinga pakaitinė hormonų terapija.
Dažniausiai skiriama estrogenų pakaitalų forma yra konjuguotas arklių estrogenas, kuris sintetinamas iš nėščios kumelės šlapimo. Jis buvo naudojamas nuo 1950 m. Be trijų natūraliai žmogaus organizme esančių estrogenų formų – estradiolio, estrono ir estriolio – konjuguotame arklių estrogene taip pat yra ekvilino – arkliams būdingos estrogeno molekulės, kurios poveikis žmogaus organizmui nežinomas. Galimas konjuguoto arklių estrogeno šalutinis poveikis yra širdies priepuolis, insultas, krūties vėžys ir giliųjų venų trombozė.
Natūralus estrogenas, dar vadinamas bioidentišku estrogenu, neseniai pasirodė kaip alternatyva konjuguotam arklių estrogenui ir kitoms sintetinėms formulėms. Jame yra tik natūraliai esančios žmogaus estrogeno molekulės estradiolis, estronas ir estriolis. Nors sintetiniai estrogenų papildai dažniausiai vartojami per burną, natūralus estrogenas dažniau vartojamas per transderminį pleistrą arba kaip kremas. Daugelis natūralios estrogenų pakaitinės terapijos šalininkų mano, kad daugelis šalutinių poveikių, susijusių su tradicine pakaitine hormonų terapija, gali atsirasti vartojant papildus. Geriamieji estrogenai taip pat kelia didesnę kraujo krešėjimo riziką nei transderminiai estrogenai.
Nors kai kurie tyrimai rodo, kad natūralus estrogenas nekelia tokio paties pavojaus kaip konjuguotas arklių estrogenas, pvz., kraujo krešulių, natūralus estrogenas yra palyginti nauja technologija, todėl iš tyrimų gaunama mažiau informacijos. Didžiausia natūralių estrogenų papildų problema yra ta, kad šiuo metu jų nereglamentuoja Jungtinių Valstijų maisto ir vaistų administracija (FDA). Daugelis vaistininkų teiginių apie natūralius estrogenų produktus yra nepagrįsti. Tačiau natūralus estradiolis ir progesteronas, kitas reprodukcinis hormonas, dažnai naudojamas pakaitinėje hormonų terapijoje, yra tiekiami FDA patvirtintuose produktuose.