Pagrindinė endokrininė liauka yra dar vienas būdas nurodyti mažytę hipofizę, esančią kaukolės apačioje, kur ji susitinka su stuburu. Iš aštuonių organizmo hormonus gaminančių liaukų tipų ši endokrininė liauka gauna užsakymus tiesiai iš smegenų centre esančio pagumburio. Kai hipofizė gauna šias hormonines išskyras iš pagumburio, ji savo ruožtu pati išskiria bet kokį hormonų skaičių, kad galėtų kontroliuoti kitas liaukas ir jų išsibarsčiusius sekretus visame kūne.
Pirmasis žodis pagrindinėje endokrininėje liaukoje gali būti labai klaidinantis. Tiesą sakant, pagumburis yra pagrindinė endorfino liauka, nes ji taip pat išskiria hormoninius signalus, kurie per vadinamąją hipofizės vartų arteriją patenka į hipofizę, kuri gamina tai, ką jai chemiškai liepta gaminti kitoms liaukoms. Be to, pagumburis išskiria kitą hormoninį junginį – somatostatiną, dėl kurio hipofizė sustabdo žmogaus augimo hormono gamybą.
Pagrindinė endokrininė liauka, tiesiogiai sujungta su pagumburiu, yra sudaryta iš trijų skirtingų gamyklų, vadinamų skiltelėmis, kurios gamina skirtingus hormonus. Oksitocinas, skatinantis gimdymą, ir antidiurezinis hormonas, didinantis vandens kiekį kraujyje, gaminamas užpakalinėje skiltyje. Hormoną, reguliuojantį odos tonusą ir pigmentą, gamina tarpinė hipofizės skiltis. Tačiau didžioji dalis darbo tenka priekinei skilčiai: prolaktinas pradeda laktaciją, augimo hormonas ir kiti junginiai, skatinantys kankorėžinę, andinkstą, skydliaukę, prieskydinę liauką ir reprodukcines liaukas.
Apskritai signaliniai hormonai siunčiami iš pagrindinės endokrininės liaukos, kad suaktyvintų skirtingą gyvybei reikalingą veiklą. Pavyzdžiui, į kiaušides ar sėklides siunčiami hormonai skatina estrogeno, progesterono ir kitų išskyrų, reikalingų moterų vystymuisi ir dauginimuisi, gamybą, taip pat testosterono ir kitų androgenų, atsakingų už vyrų reprodukcinę funkciją, gamybą. Panašiai, norint kontroliuoti skydliaukę kakle, pagrindinė endokrininė liauka gauna tirotropiną atpalaiduojantį hormoną iš pagumburio, tada gamina ir siunčia hormoninę žinutę skydliaukei. Tada ši liauka suaktyvinama, kad skydliaukės hormonai būtų atsakingi už keletą svarbių kūno funkcijų, pradedant kraujo ir širdies reguliavimu, baigiant raumenų palaikymu ir maisto virškinimu.
Nors techniškai nėra liauka, už skrandžio esanti kasa atlieka keletą svarbių liaukų funkcijų. Viena iš dviejų šio organo dalių gamina hormonus. Endokrininė kasa gamina tokius hormonus kaip insulinas, kuris palaiko tinkamą organizmo cukraus kiekį kraujyje. Kita dalis, vadinama egzokrinine kasa, daro fermentus labai svarbius sveikam virškinimui.