Patogenezė yra ligos vystymasis nuo pradinio ligos atsiradimo iki jos pabaigos. Patogenezės tyrimas yra svarbus medicinos specialistams, nes padeda atpažinti ir gydyti ligas. Tai taip pat yra laboratorinių mokslų, dirbančių ligų gydymo ir gydymo srityse, darbo dalis, nes kiekvienas vystymosi etapas yra potenciali galimybė sustabdyti ligos progresavimą.
Terminas „patogenezė“ kilęs iš graikų kalbos žodžių „liga“ ir „pradžia“. Ligos ištakos yra pirmasis patogenezės žingsnis, kaip ir progresuojantys organizmo pokyčiai, ligai įsitvirtinus ir pradėjus veikti organizmą. Pavyzdžiui, kai ką nors pjauna ir žaizdą kolonizuoja Staphylococcus bakterijos, pradėjusios plisti bakterijos sukelia uždegimą ir galiausiai sukelia infekciją. Kiekvienas žingsnis nuo pjūvio iki visiškos infekcijos yra vystymosi dalis.
Yra keletas patogenezės tyrimų panaudojimo būdų. Atskirų pacientų atveju tai leidžia gydytojui nustatyti, kas sukėlė ligą ir kaip ligą galima gydyti. Galimybė nustatyti ligos stadiją gali būti svarbi ir gydančiam gydytojui, pavyzdžiui, onkologui, norinčiam nustatyti vėžio sunkumo laipsnį.
Ligos vystymosi tyrimas taip pat gali padėti suprasti ligų plitimo būdus ir galbūt prisidėti prie programos, skirtos sulėtinti ligų plitimą, kūrimo. Pavyzdžiui, pirmiau pateiktame užkrėsto pjūvio pavyzdyje, infekcijos galėjo būti išvengta reguliariai valant žaizdą antibakteriniu muilu – procedūra, kuri visame pasaulyje plačiai naudojama namuose ir ligoninėse siekiant sumažinti infekcijos riziką. Ši sritis taip pat yra svarbi naujų ir atsirandančių ligų tyrimo dalis, nes su šiomis ligomis negalima veiksmingai kovoti nesuvokus, iš kur jos atsiranda.
Nemažai medicinos sričių susikerta su patogeneze, įskaitant patofiziologiją, ligų progresavimo organizme sukeltų pokyčių tyrimą ir epidemiologiją – ligų raidos ir judėjimo populiacijose tyrimą. Ligos raidos tyrimas yra ypač svarbus medikams, nes leidžia imtis priemonių įvairių ligų prevencijai, diagnozavimui ir gydymui. Daugelis pasauliečių taip pat tam tikru mastu yra susipažinę su patogeneze, pavyzdžiui, žmonėms, kurie yra susipažinę su pasikartojančių sinusų infekcijų progresavimu, arba žmonėms, kurie plauna rankas, kad sumažintų ligą galinčių sukelti medžiagų poveikį.