Peptidinis antigenas – tai peptido panaudojimas gyvūno imuninei sistemai suaktyvinti ir sukurti antikūnus prieš tą peptidą. Peptidai yra trumpos aminorūgščių eilutės; ilgesnės grandinės žinomos kaip baltymai. Peptidinis antigenas gali būti naudojamas kaip vakcinos kūrimo dalis.
Peptidai yra organinės molekulės, sudarytos iš azoto, deguonies, anglies, vandenilio ir dažniausiai sieros. Jie yra aminorūgščių grandinės ir yra sujungtos peptidine jungtimi. Peptidiniai ryšiai yra dviejų greta esančių aminorūgščių NH2 ir COOH grupių jungtys.
Antigenas yra molekulė, kuri jungiasi su antikūnu ir sukuria imuninį atsaką – organizmo reakciją į svetimas molekules. Ne visų tipų molekules imuninė sistema gali atpažinti. Baltymai, peptidai ir cukrų grandinės gali veikti kaip antigenai.
Taip pat yra žmogaus antigenų. Tai apima baltymus, esančius naviko ląstelių paviršiuje. Tokių antigenų gali būti ir kraujyje. Tai yra prostatos specifinio antigeno tyrimo, kuris dažniausiai naudojamas prostatos vėžio atrankai, pagrindas. Kai kurie antigenai yra sąmoningai įvedami, kad veiktų kaip vakcinos ir sukurtų imuninį atsaką.
Antikūnai yra baltymai kraujyje, kurie neutralizuoja specifinį antigeną. Antikūnas atpažįsta tik kai kurias molekulės dalis. Antikūno gale yra paratopas, atpažįstantis sudėtingą antigeno struktūrą. Šis antikūno regionas yra atsakingas už didelę antikūnų įvairovę organizme. Vienas žmogus gali turėti milijonus skirtingų antikūnų.
Dažnai naudojami peptidiniai antigenai, nes jie yra didesnio baltymo, kuris gali būti neišvalytas, dalis. Naudojant peptidinį antigeną antikūnams gaminti, svarbu, kad tyrėjas naudotų antigeninę peptido sekciją. Antigenų specialistai gali padėti sukurti antigeną, kad padidintų tikimybę, kad peptidas, naudojamas kaip antigenas, sukurs antikūną. Daug lengviau nuspėti, kurie epitopai yra veikiami, jei žinome apie trimatę junginio struktūrą.
Daugeliu atvejų nėra žinių apie bendrą peptido struktūrą, nors nuspėjamoji programinė įranga gali analizuoti, kuri peptido dalis gali būti antigeninė. Peptidai, kurie greičiausiai susidurs su antikūnu, yra tie, kurie yra ląstelės paviršiuje. Tikėtina, kad jie yra hidrofiliniai – tirpūs vandenyje. Lankstumas taip pat yra svarbus peptidinio antigeno reakcijos su epitopu kriterijus.
Nustačius tinkamą peptidinį antigeną, sukuriamas sintetinis peptidas. Tada jis gali būti naudojamas imunizacijai. Jis švirkščiamas gyvūnui, kad būtų sukurtas imuninis atsakas. Išskyrus antikūnus, jie analizuojami, siekiant įsitikinti, kad organizmas sukūrė veiksmingą imuninį atsaką.
Vienas įprastas būdas patikrinti, ar antikūnai yra specifiniai norimam baltymui, yra Western Blot tyrimas. Tai apima baltymų, kuriuose yra peptido, atskyrimą ant gelio naudojant elektros srovę. Tai vadinama elektroforeze. Tada baltymai perkeliami į membraną ir tiriami antikūnu.
Jei yra baltymui specifinių antikūnų, jis prisijungs prie membranos esančio baltymo. Membrana nuplaunama ir apdorojama antriniu antikūnu. Jei antikūnai buvo sukurti, pavyzdžiui, pelėje, antrinis antikūnas būtų antikūnas prieš pelę. Šis antikūnas sukurtas taip, kad generuotų spalvą arba liuminescenciją, kad tyrėjas galėtų matyti, kur pradinis antikūnas susijungė.