Kas yra pirimidinas?

Pirimidinas yra molekulių grupė, kuri yra DNR ir RNR struktūros dalis. Šios molekulės turi vieną žiedo struktūrą, sudarytą iš šešių atomų. Yra keletas pirimidino molekulių, tačiau tik citozinas ir timinas yra DNR struktūros dalis, o citozinas ir uracilas yra RNR struktūros dalis. Šios molekulės jungiasi su savo purino analogais, kad sujungtų dvi DNR arba RNR polimero grandines. Į pirimidiną panašūs vaistai buvo naudojami tam tikroms ligoms, įskaitant odos vėžį ir keratozę, gydyti.

Citozinas, timinas ir uracilas turi šešių narių žiedo struktūrą. Uracilas turi du deguonies atomus, prijungtus prie žiedo. Citozinas turi vieną deguonies atomą ir vieną amino grupę (-NH2), prijungtą prie žiedo, o timinas turi du deguonies atomus ir metilo grupę (-CH3), prijungtą prie žiedo. Kiekvienos iš šių pirimidino molekulių žiedo struktūroje yra du azoto atomai ir keturi anglies atomai.

Pirimidinai jungiasi su purinais, kad sujungtų dvi DNR arba RNR polimero grandines. Adeninas ir guaninas yra purinai, kurių kiekvienas turi penkių ir šešių narių žiedą, kurie yra sujungti. DNR citozinas jungiasi su guaninu, o timinas – su adeninu. Citoziną ir guaniną jungia trys vandenilio ryšiai, o timino ir adenino ryšį sudaro du vandenilio ryšiai. RNR uracilas užima timino vietą ir jungiasi su adeninu.

Kai cukraus grupė yra susieta su pirimidinu arba purinu, ji vadinama nukleozidu. Deoksicitozinas ir (deoksi)timidinas yra pirimidino nukleozidai, o deoksiadenozinas ir deoksiguanozinas yra purino nukleozidai. DNR cukrus yra dezoksiribozė, kuri yra penkių anglių cukraus molekulė, kuriai trūksta hidroksilo grupės (-OH), paprastai esančios ribozės cukraus molekulėje. Su RNR cukraus molekulė yra ribozė, o nukleozidai paprastai vadinami be „deoksi“ priešdėlio.

Visas nukleotidas susideda iš azoto bazės, kuri yra pirimidinas arba purinas, cukraus molekulės ir fosfato grupės. Fosfato grupė jungiasi prie nukleozido cukraus molekulės per esterio jungtį. Vienas nukleotidas yra sujungtas su kitu nukleotidu fosfodiesterio ryšiu.

Fluurouracilas yra vaistas, panašus į pirimidino uracilą. Paprastai jis vartojamas tam tikro tipo odos vėžiui, vadinamam paviršine bazalioma, ir kitoms odos ligoms, įskaitant pleiskanojančius ar suragėjusius pažeidimus, atsiradusius dėl per daug saulės poveikio, gydyti. Vaistas paprastai parduodamas kremo pavidalu.