Žmonių viduje vyrų ir moterų reprodukcinės sistemos fiziologija skiriasi. Abiejų lyčių organizme reprodukcinės sistemos fiziologiją sudaro išoriniai ir vidiniai lytiniai organai bei lytinės liaukos, tačiau tai, kas ir kur yra šie organai, labai skiriasi. Genitalijos yra organai ir kūno dalys, kurių reikia dauginimuisi. Lytinės liaukos yra organai, atsakingi už reprodukcinių lytinių ląstelių arba lytinių ląstelių gamybą.
Patinų reprodukcinės sistemos fiziologija apima keletą kūno dalių ir organų. Išoriniai lytiniai organai susideda iš varpos ir kapšelio. Vidiniai lytiniai organai dažniausiai randami šiose vyrų kūno dalyse ir apima sėklides, epididimį, kraujagysles, sėklines pūsleles, šlaplę ir prostatą. Vyriškos lytinės ląstelės arba spermatozoidai gaminami sėklidėse, kurios yra vyriškos lytinės liaukos.
Nors dauguma vyrų reprodukcinių organų yra išoriniuose lytiniuose organuose, tai netinka moterims. Moterų reprodukcinės sistemos fiziologija daugiausia randama apatinėje pilvo dalyje. Išorinius lytinius organus sudaro lytinės lūpos ir klitoris, kurie yra labai įtempti seksualinei stimuliacijai. Dauguma organų yra vidiniai ir apima makštį, gimdos kaklelį, gimdą, kiaušintakius ir kiaušides. Kiaušialąstės arba kiaušinėliai gaminasi patelių kiaušidėse.
Skiriasi ne tik patinų ir patelių reprodukcinės sistemos fiziologija, bet ir procesas, kurio metu gametos gaminamos ir pristatomos dauginimosi metu. Spermatogenezė yra spermatozoidų gamybos procesas sėklidžių sėklidžių kanalėliuose, kuris tęsiasi visą žmogaus gyvenimą. Kai spermatozoidai yra pagaminti, jie subręsta ir yra laikomi prielipyje, ruošiantis apvaisinti. Prieš ejakuliaciją spermos ląstelės sumaišomos su sėkliniu skysčiu iš prostatos liaukos ir sėklinės pūslelės, kad susidarytų sperma. Ejakuliacijos metu sperma išeina iš varpos per šlaplę.
Patelėse visos kiaušialąstės yra nuo pat gimimo ir daugiau kiaušialąstės nesigamins per visą moters gyvenimą. Pradedant brendimo laikotarpiu, kiaušialąstės pradeda bręsti kiaušidėse ir kiekvieną mėnesį iš vienos kiaušidės išsiskiria viena subrendusi kiaušialąstė. Tai pakaitomis tarp jų dviejų. Tada jis per kiaušintakį juda į gimdą. Jei spermatozoidas neapvaisinamas, menstruacijų metu kiaušinėlis ir gimdos gleivinė išstumiami per gimdos kaklelį ir makštį.