Kas yra ribosominės RNR sekos nustatymas?

Ribosomų ribonukleino rūgšties (RNR) sekos nustatymas yra nukleorūgščių, sudarančių ribosomą, sekos nustatymo procesas. Beveik visose ląstelėse ribosomos yra makromolekulės, sudarančios baltymus, kad ląstelė veiktų. Jie sudaryti iš RNR ir įvairių baltymų, kurie padeda RNR veikti efektyviau. Didelė dalis šios ribosomoje esančios medžiagos yra tiesiogiai susijusi su baltymų kūrimu, todėl ribosomų RNR sekos nustatymas gali suteikti įžvalgų apie galutinę molekulės struktūrą, taip pat apie tai, kaip ji veikia. RNR funkcija ir bendra struktūra yra gerai išsaugota tarp įvairių rūšių, tačiau neapdorota seka nėra, o sekos pokyčiai gali būti naudojami informacijai apie ribosomų evoliuciją nustatyti.

Nesvarbu, ar naudojama bakterijų ribosomoms, ar sudėtingesnių organizmų ribosomoms, ribosomų RNR sekos nustatymas atliekamas panašiai. Kai RNR yra atskirta nuo ribosomos, ji daug kartų dubliuojama, tada suskaidoma į mažus fragmentus, kurių sekas galima lengvai identifikuoti. Tada tos mažos sekos dalys surenkamos iš naujo, kad būtų sukurta naujai nustatyta seka. Užduotis tampa sudėtingesnė, nes seka ilgėja, tačiau procesas vis dar yra gana lengvas ribosomų RNR, kuri yra palyginti maža. Nėra garantijos, kad pirmasis bandymas nustatyti ribosomų RNR seką pirmą kartą bus teisingas, todėl dažniausiai bandoma patikrinti duomenų kokybę.

Duomenys, gauti iš ribosomų RNR sekos nustatymo, gali būti naudojami įvairiems tikslams, tačiau vienas iš labiausiai paplitusių yra bakterijų identifikavimas. Visų pirma, bakterijų ribosominė RNR yra labai konservuota tarp rūšių, todėl sekos nustatymas leidžia unikalias rūšies savybes konsoliduoti į profilį, kad būtų galima nuoroda. Šis profilis gali būti naudojamas norint greitai ir lengvai nustatyti konkretų bakterijų tipą, o tai gali padėti diagnozuoti ir gydyti ligonius. Atsiradus geresnei sekos nustatymo technologijai, šis metodas tapo dažnesnis diagnozuojant.

Antrasis poveikis, kurį ribosomų RNR sekos nustatymas gali turėti žmonių sveikatai, yra pagalba kuriant vaistus ir vaistus. Bakterijų ribosomų RNR sekos turi daug posekių, kurios būdingos tik bakterijoms, todėl taikant šias sritis antimikrobiniais vaistais galima sunaikinti bakterijas, nepakenkiant žmonėms. Ribosominės RNR sekos nustatymo duomenys nesuteikia pakankamai duomenų, kad būtų galima sukurti vaistus, tačiau mokslininkai gali sutelkti dėmesį į būsimus tyrimus ir vaistų kūrimą. Galima sukurti vaistinių molekulių, kurios prisijungia prie sekų ir išjungia ribosomą. Įvairūs dabartiniai vaistai naudoja šį metodą kovai su ligomis.