Kas yra RNR pradmenys?

Ribonukleino rūgšties (RNR) pradmenys atlieka esminį vaidmenį dezoksiribonukleino rūgšties (DNR) replikacijoje, DNR molekulių kopijavimo procese, kuris vyksta visuose gyvuose organizmuose. Replikacija leidžia organizmui perduoti savo palikuonims genetinę informaciją, esančią jo DNR kopijoje. RNR pradmenys padeda inicijuoti replikaciją molekuliniu lygiu. Jie veikia kartu su keliais fermentais arba baltymais, kurie katalizuoja šiame procese dalyvaujančias reakcijas.

RNR, kaip ir DNR, yra molekulė, susidedanti iš subvienetų, vadinamų nukleotidais. Kiekvienas RNR arba DNR grandinės nukleotidas turi cheminį junginį, žinomą kaip nukleobazė. DNR nukleobazės yra adeninas, timinas, guaninas ir citozinas. RNR vietoj timino naudojamas junginys uracilas, tačiau kitos nukleobazės yra tokios pačios kaip ir DNR.

Kiekviena RNR arba DNR grandinės nukleobazė chemiškai susijungia su komplementaria nukleobaze kitoje DNR arba RNR grandinėje, sudarydama bazių porą, sukurdama dvigubą spiralę. Adeninas poruojasi su timinu arba uracilu, o guaninas – su citozinu. Pasikartojančių vienetų modelis sukuria seką, kurioje gali būti saugoma genetinė informacija.

Replikacijos metu fermentas helikazė suskaido ryšius tarp nukleotidų ir atskiria DNR molekulę į dvi sudedamąsias dalis. Kitas fermentas – DNR polimerazė – prie kiekvienos grandinės prijungia papildomus nukleotidus. Šis procesas sukuria originalios DNR molekulės dublikatą, naudojant kiekvieną iš dviejų vienas kitą papildančių grandžių kaip šabloną.

DNR polimerazė gali pridėti nukleotidų į besivystančią grandinę, bet negali sukurti naujos grandinės nuo nulio. Čia atsiranda RNR pradmenys. RNR pradmenys yra trumpos grandinės, kurių kiekviena sudaro apie 10 arba 11 nukleotidų, ir yra suformuotos fermento primazės. Primasė jungiasi su helikaze ir sudaro struktūrą, vadinamą primosoma. Primosoma prijungia papildomus nukleotidus prie vienos grandinės DNR molekulės, sukurdama RNR pradmenį, o RNR pradmenų veikimas išilgai grandinės sukelia DNR polimerazę.

Dėl atomų išsidėstymo nukleotidų molekulėse DNR ir RNR grandinės turi kryptingumą – kiekviena grandinė turi tam tikrą orientaciją. Sruogų galai pavadinti pagal nukleotidų molekulės, su kuria jie baigiasi, plotą. Penkių pirminių (5′) grandinės galas baigiasi penktuoju anglies atomu molekulės anglies žiedo struktūroje. Komplementarios grandinės yra orientuotos viena priešais kitą, todėl kita grandinė toje vietoje turėtų trijų pagrindinių (3′) galą, besibaigiantį trečiajame anglies atome. Norėdami tai įsivaizduoti, jei viena dvigubos spiralės kryptis eina nuo 5 iki 3 colių iš kairės į dešinę, priešinga kryptis turi eiti nuo 3 iki 5 colių iš kairės į dešinę.

DNR polimerazė gali pridėti nukleotidus tik prie 3′ galo, dirbdama link 5′ galo. Norint pradėti šį procesą nuo pirmaujančios grandinės, kuri baigiasi 3′, reikia tik vieno RNR pradmens. Priešingos atsiliekančios krypties replikacija yra sudėtingesnė. DNR polimerazė su pertrūkiais prideda nukleotidus atgal išilgai šios grandinės, veikdama trumpomis sekomis, kai grandinės suskaidomos. Kiekvienos sekos pradžioje reikia RNR pradmenų, todėl norint atkartoti atsilikusią grandinę, reikia kelių RNR pradmenų.