Sąlyginio deponavimo apskaita registruoja ir praneša apie finansines operacijas, susijusias su dviem atskiromis šalimis. Sąlyginio deponavimo sandoriai dažniausiai randami bankininkystės ir finansinių paslaugų sektoriuje. Asmenys, gaunantys paskolas iš bankų, skolintojų ir finansų institucijų, paprastai įdeda pinigus į depozitoriumą. Šios lėšos išleidžiamos įvykdžius konkrečias paskolos sąlygas. Apskaitos procedūros atskiria sąlyginio deponavimo lėšas nuo kitų pinigų apskaitos knygoje. Nė viena šalis neturi nevaržomos prieigos prie pinigų kitiems tikslams, neatitinkantiems sąlyginio deponavimo gairių.
Verslo aplinkoje dažniausiai naudojamos bendrosios ir palūkanas duodančios depozitinės sąskaitos. Hipotekos bendrovės pirmiausia naudoja bendras sąlyginio deponavimo sąskaitas. Pirkėjai į šią sąskaitą įdeda pinigų, susijusių su būsto pirkimu. Nuosavybės teisės arba hipotekos bendrovė reikalauja, kad pirkėjai deponuotų pinigus į sąlyginio depozito sąskaitą būsimiems mokėjimams, susijusiems su hipotekos palūkanomis, būsto savininkų draudimu ir nekilnojamojo turto mokesčiais. Palūkanas nešančios sąskaitos leidžia vadovams kaupti palūkanas už sąlyginio deponavimo pinigus, kuriuos naudoja finansinėje operacijoje dalyvaujančios šalys. Bendrosios sąlyginio deponavimo sąskaitos neturėti šios funkcijos.
Sąlyginio depozitoriumo apskaitos lygtis yra turtas lygus įsipareigojimams. Sąlyginio deponavimo apskaitoje savininko nuosavo kapitalo ar nepaskirstytojo pelno nerasta. Sąlyginio deponavimo buhalteriai turi patikėtinio pareigą apdoroti lėšas iš abiejų finansinės operacijos šalių. Buhalteriai turi apsaugoti pinigus nuo nuostolių, kurie gali būti susiję su bet kurios šalies nesugebėjimu atlikti savo pareigų finansinėje operacijoje. Finansinės operacijos yra atskiri įrašai didžiojoje knygoje. Didžiojoje knygoje pateikiama informacija, susijusi su visomis deponavimo finansinėmis operacijomis.
Panašiai kaip ir įprastos apskaitos procedūros, deponavimo apskaitos didžiosiose knygose gali būti naudojamos papildomos knygos arba žurnalai finansinėms operacijoms įrašyti. Sąlyginio deponavimo apskaitoje dažniausiai randami grynųjų pinigų išmokėjimo ir kasos pajamų žurnalai. Grynųjų pinigų išmokėjimo žurnalas apima finansines operacijas, susijusias su sąlyginio deponavimo lėšų mokėjimu. Sąlyginio deponavimo lėšos išmokamos, kai viena arba abi šalys atlieka savo pareigas, susijusias su depozitoriumo sąskaita. Kasos pajamų žurnale įrašomi visi pinigai, gaunami deponavimo tikslais. Kasos pajamų žurnalas gali apimti išsamią informaciją, susijusią su kiekviena sąlyginio deponavimo sandorio šalimi, kiekvienos šalies finansinę atsakomybę ir kitą susijusią informaciją.
Suderinimas yra svarbi sąlyginio deponavimo apskaitos dalis. Buhalteriai kas savaitę arba kas mėnesį peržiūrės informaciją, susijusią su atskiromis sąlyginio deponavimo sąskaitomis. Kiekviena sąlyginio deponavimo sąskaita yra patikrinama siekiant užtikrinti, kad pinigų įplaukos ir išplaukos tinkamai atspindėtų sąlyginio deponavimo lėšas. Sąlyginio deponavimo sąskaitų skirtumus gali prireikti taisyti, siekiant užtikrinti, kad kiekviena šalis visiškai laikytųsi savo įsipareigojimų dėl depozitoriumo. Sąlyginio deponavimo sąskaitos paprastai kiekvienai šaliai išduoda rašytinius pareiškimus, kuriuose nurodoma dabartinė depozitinės sąskaitos būsena.